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大豆花叶病毒武汉分离物全基因测序及系统进化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 邓克林;卢自华;李艳娇;杨远霄;黎超;陈水莲;杨红丽;单志慧;郝青南;陈海峰

作者机构：

关键词： 大豆花叶病毒;武汉分离物;全基因测序;系统进化

期刊名称：湖北农业科学

ISSN： 0439-8114

年卷期： 2025 年 9 期

页码：

收录情况： 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2024版）

摘要： 从武汉采集表现花叶症状的大豆叶片,通过RT-PCR检测和全基因组扩增,获得一株大豆花叶病毒(SMV),命名为SMV-WH.SMV-WH的基因组全长为9 940 nt,其编码多聚蛋白的开放阅读框位于111～9 719 nt.序列分析表明,SMV-WH与GenBank中164个SMV的全基因组核苷酸序列一致性在74.88%～98.36%,氨基酸序列一致性为75.15%～99.09%,表明SMV-WH具有较高的遗传多样性.系统进化分析显示,SMV-WH与来自中国的分离株LJZ010、LJZ002、DSMZ PV-0841、DSMZ PV-0938、JSJJ00和SCSN及来自韩国的分离株Anseong聚为一簇,与Anseong和SCSN亲缘关系最近.蛋白1(P1)中E299K的突变改变了蛋白激酶C磷酸化位点,而辅助组分蛋白酶(HC-Pro)中G593S的突变改变了酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点.三维结构预测表明这些突变引起了蛋白构象的变化.

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