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鸭胸肌矿物元素含量全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

作者： 余大新;刘文静;刘大鹏;刘同;张鹤;盖凯;李姝楠;张贝贝;侯水生;周正奎

作者机构：

关键词： 鸭;胸肌;矿物元素;全基因组关联分析;遗传力

期刊名称：中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2023 年 50 卷 04 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2023版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 【目的】试验旨在利用全基因组关联分析（GWAS）鉴定影响鸭胸肌矿物元素含量的候选基因及分子标记，解析矿物元素性状的遗传机制。【方法】研究构建了北京鸭×野鸭F2代资源群体，利用个体血液样本进行全基因组重测序，采集8周鸭胸肌并根据国标方法测定7种常量矿物元素含量，结合重测序数据与矿物元素表型数据进行全基因关联分析，鉴定影响矿物元素含量相关基因。【结果】7种矿物元素的表型遗传力分别为磷（0.007）＜铁（0.100）＜镁（0.120）＜钠（0.140）＜钾（0.150）＜钙（0.190）＜锌（0.350）。相关性分析结果表明，镁和钾元素相关性最高（r=0.62）,磷与镁、钾元素在鸭胸肌中的含量呈现较高的正相关，r值分别为0.43和0.56。通过GWAS鉴定出与锌元素含量显著相关的1个SNP位点在6号染色体12 075 283 bp处达到全基因组水平上的显著关联(-log10P-value=8.03),与最高点SNP高度相关的39个SNPs将候选区间缩小至39 kb,该区间内仅存在1个基因SORCS3,结合基因功能注释与转录组分析确定SORCS3为锌元素含量变异的候选基因。与磷元素含量表型数据在全基因组水平上达到显著相关的最高点SNP与260个SNPs高度相关（R~2＞0.4）,均位于4号染色体17.1—18.6 Mb之间，且包含27个基因。结合相关性分析、基因功能注释及转录组分析，最终确定6个与磷元素含量高度相关的候选基因：TUSC3、MICU3、LOC101803915、MTMR7、SLC7A2和ASAH1。【结论】本研究利用全基因组关联分析鉴定出鸭胸肌锌元素含量候选基因SORCS3,同时结合转录组分析鉴定出与磷元素含量相关的6个候选基因。结果丰富了禽肉矿物营养的知识体系，为培育优良畜禽产品提供了重要的理论基础。

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