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红光促进棉花胚性愈伤诱导的转录组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 葛梦杰;张朝军;栗战帅;王小艳;孙志茂;陈柏志;张迁;乔凯凯;马常凯;曹晓聪;吕娇艳;王龙;王艳文;张茹佳;聂君伟;马启峰;陈全家;范术丽

作者机构：

关键词： 棉花;愈伤组织;转录组;差异表达基因

期刊名称：分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2023 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; 科技核心（2023版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 为探究红光促进棉花胚性愈伤组织形成的分子机理。本研究以陆地棉CCRI24为试验材料，利用RNA-seq技术对在红光、白光培养条件下的不同阶段棉花愈伤组织进行转录组测序，分析胚性愈伤形成过程的基因表达水平。对2个不同光处理愈伤组织共计8个样品进行转录组测序，共获得54.92 Gb clean date。与白光相比，5 d、15 d、20 d、30 d的非胚性愈伤组织中差异表达基因分别有261、58、139、44个上调，454、157、328、507个下调。GO功能富集分析表明，两种光质条件下的棉花愈伤组织差异表达基因的功能主要富集到细胞核、细胞膜等与细胞分裂有关的代谢过程。KEGG富集分析结果显示，红光与白光条件下的愈伤组织间差异表达基因主要参与光合作用-天线蛋白、玉米素合成、二萜类生物合成、类黄酮生物合成等代谢通路。研究结果表明，与胚性愈伤组织形成相关的8个基因的差异表达趋势与转录组测序分析结果一致。本研究为光质影响棉花胚性愈伤诱导的相关基因表达提供了数据，为解析棉花胚性愈伤愈伤组织诱导与形成的分子机制提供参考。

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