海岛棉纤维强度QTL紧密连锁InDel分子标记开发及效应评价
文献类型: 中文期刊
作者: 吕涛;孙国清;郭栋材;陈全家;蔡永生;樊标星;曲延英;郑凯
作者机构:
关键词: 海岛棉;纤维强度;InDel标记;种质资源;组合分子标记
期刊名称:中国农业科学
ISSN: 0578-1752
年卷期: 2025 年 9 期
页码:
收录情况: 北大核心(2023版) ; ; CSCD(2025-2026年度) ; ; 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2024版)
摘要: [目的]海岛棉具有优异的纤维品质,纤维断裂比强度是棉花纤维品质的一个重要指标.开发InDel分子标记,通过RIL群体和资源材料进行验证,并分析其有效性,为选育优异纤维品质海岛棉新品种提供一定的理论依据.[方法]以前期构建的 213 份Pima S-7 和 5917 F5:6 重组自交系(RIL)群体为材料,进行QTL定位,获得调控海岛棉纤维强度数量性状基因座位点qFS-chr17-1,根据亲本全基因组测序(WGS)数据开发设计InDel 标记,并在亲本间筛选多态性标记.根据表型数据选取 40 份极端家系材料初步验证所开发的多态性标记.在 213 份RIL群体和 213 份海岛棉资源材料中进行基因分型,并结合多年纤维品质数据验证标记的有效性.[结果]利用开发的2个InDel标记在RIL群体与海岛棉资源材料进行基因分型检测,结果表明,2个标记能够与纤维强度表型数据紧密连锁,所区分材料间纤维强度性状具有显著差异.通过组合2个标记基因型检测结果,发现 4 种组合类型的纤维强度呈现上升趋势,且携带Hap3(B/A)与Hap4(B/B)基因型的材料纤维强度显著强于Hap1(A/A)与Hap2(A/B).InDel-3L2 标记与纤维长度、纤维整齐度和纺纱一致性指数等纤维品质性状显著相关,所区分材料表型趋势与相关性分析结果一致.根据多年环境下两试验点的纤维品质数据分析,发现不同环境间的纤维品质有差异,结合气温数据,发现所开发的分子标记受环境影响小.通过对213份海岛棉资源材料纤维品质数据进行聚类分析,并结合分子标记分型结果,共筛选出8份优异纤维品质材料.[结论]针对海岛棉纤维强度QTL位点(qFS-chr17-1)开发出2个与纤维强度紧密连锁的InDel分子标记,将两标记分型结果组合后仍具有有效性.InDel-3L2可以与纤维长度、纤维整齐度和纺纱一致性指数连锁.开发的InDel标记可以高效准确地检测海岛棉纤维高强度资源材料,可以用于海岛棉纤维品质改良育种.还筛选出8份优异纤维品质材料.
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