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基于高深度基因组重测序的‘铁观音’茶树无性繁殖后代遗传变异研究

文献类型： 中文期刊

作者： 侯炳豪;高婷;魏月德;高水练;蔡银笔;陈志明;金珊;张兴坦;王鹏杰;叶乃兴

作者机构：

关键词： 茶树;铁观音;无性繁殖;重测序;遗传变异

期刊名称：园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2023 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2023版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 对茶树[Camellia sinensis（L.）O. Kuntze]‘铁观音’母树及其连续3代无性繁殖后代和3个经多代无性繁殖的生产茶园叶片进行超过50× 的高深度基因组重测序。通过SNP和InDel检测与注释，发现大部分变异位于基因间区，只有1.09% ～ 1.13%的SNP和0.51% ～ 0.61%的InDel位于基因编码区。在全基因组和编码区范围内，连续3代无性繁殖后代的样本之间总变异位点数均差别不大，各样本中涉及突变的基因数基本一致，推测‘铁观音’品种的种性在无性繁殖过程中总体保持稳定。与母树间差异基因的KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）富集结果表明，生产茶园样本在嘌呤类和糖类代谢通路中显著富集，并在咖啡碱代谢通路中呈极显著富集，推测‘铁观音’品种在长时间无性繁殖过程中，部分与品质相关的代谢通路基因发生变化。与前3代样本相比，FAR1、WAT1和MYB 等3个与生长发育相关，PP2A、BTB/POZ、BAT2、RPP13和Lr10等5个与逆境响应相关的基因序列在生产茶园样本中发生了变异。

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