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菜豆花色全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

作者： 卢甜甜;刘志远;徐兆生;张合龙;李国亮;折红兵;钱伟

作者机构：

关键词： 菜豆; 全基因组关联分析; 花色; 表达

期刊名称：园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2022 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2021-2022年度） ; 科技核心（2021版） ; 农林核心（2020版）

摘要： 以124份菜豆为试验材料，分别在2019年和2020年调查花色表型，利用全基因组关联分析（GWAS）的方法对调控花色的基因进行挖掘。结果表明：2年间供试菜豆花色表型基本一致，仅有1份材料存在差异。对124份菜豆材料进行重测序共获得 517.58Gb的数据量（10×），通过与菜豆参考基因组比对，获得5130030个SNP，过滤后得到3701584个SNP。利用这些高质量的 SNP 基于压缩混合线性模型（compress mixed linear model，cMLM）将菜豆花色调控基因定位在6号染色体 322.67 kb 的区域内；在候选区域内共鉴定到8个基因，其中，Phvul.006G020200为参与花青素调控的MYB 转录因子基因，且在不同花色材料中差异性表达，为调控菜豆花色的关键候选基因。

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