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大豆中GmKAB1基因的克隆和信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 朱晓玲;郝青南;陈海峰;王程;陈李淼;沙爱华;陈水莲;周蓉;周新安

作者机构：

关键词： 大豆;钾离子通道基因;克隆;实时荧光定量PCR;生物信息学分析;同源性分析;系统发育分析

期刊名称：中国油料作物学报

ISSN： 1007-9084

年卷期： 2014 年 36 卷 01 期

页码： 18-24

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探讨GmKAB1在大豆处于低钾胁迫下的表达水平,以大豆钾高效品系油06-71和钾敏感型品系衡春04-11为试验材料,设置低钾胁迫试验,分别在处理后0.5h、2h、6h、12h、3d、6d、9d和12d取样提取RNA,利用Real time-PCR检测各时间段GmKAB1基因的表达量。结果显示GmKAB1基因在地下部分表达比地上部持续时间更长,地下部相对表达倍数最高为3.5,较地上部相对表达倍数更高。克隆目的基因并对基因序列进行同源性及生物信息学分析,结果表明,与GmKAB1基因相似性在30%以上的同源基因有45个,GmKAB1在进化树中的位置与Glyma20g19000最近;GmKAB1编码蛋白为稳定的可溶性蛋白,具有2个保守结构域,多个磷酸化位点,表明在受到低钾胁迫后该基因编码的β亚基与α亚基结合调控电压门控钾离子通道,对大豆从根部获取钾离子可能起着关键作用。

分类号： S565.1

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