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猪繁殖与呼吸综合征病毒CH-LA株非结构基因的分子克隆及其基因特征的研究

文献类型： 中文期刊

作者： 刘光清;薛强;仇华吉;蔡雪晖;童光志;郭宝清

作者机构：

关键词： PRRSV;非结构基因;非结构蛋白编码区;序列分析

期刊名称：中国预防兽医学报

ISSN： 1008-0589

年卷期： 2002 年 24 卷 002 期

页码： 81-87

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对猪繁殖与呼吸综合征病毒的非结构基因(ORFL)和非编码区分别进行了克隆和测序,并对其基因特征作了分析.结果表明,CH-LA株ORFL全长11882NT,其中ORFLA长7512NT、ORFLB长4374NT.它们与VR2332株的核苷酸同源性分别为89%、92%;与LV株的核苷酸同源性分别为54%、63.3%.ORFL编码两个聚合蛋白,其中ORFLA编码的聚合蛋白经裂解后产生6个成熟的非结构蛋白(NSPLα、NSPLβ、NSP2-5),以NSP2的变异性最为显著,它与LV株的氨基酸同源性为41%.ORFLB编码的聚合蛋白经裂解后,产生4个成熟的非结构蛋白(RDRP CP24),其中RDRP为病毒的复制酶,CP4表现出较大的变异性,与LV株的氨基酸同源性为48%.在ORFLA-ORFLB的衔接区有保守的庚核苷酸滑动序列和拟节结构,它们是核糖体移码翻译所必需的结构.在基因组末端存在非编码区,其中5''NCR长190NT,比LV株5''NCR短31NT,其核苷酸同源性为61%.3''NCR长151NT,比LV株3''NCR长37NT,保守性稍高,其与VR2332株和LV株的核苷酸同源性分别为95.4%和78.2%.在3''NCR末端有一个POLY(A)尾巴,长20NT.在POLY(A)尾上游有保守的八核苷酸序列,是复制酶识别并结合的区域.本研究进一步证实CH-1A株在基因型上属于北美洲型.

分类号： S852.65%Q78

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