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猪NLRC5基因启动子克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘翔;尹灵丹;薛美;李亮;赵立媛;蒋成凡;王文哲;冯力;刘平黄

作者机构：

关键词： 启动子质粒;双荧光素酶;NLR家族含CARD结构域5(NLRC5)基因;启动子调控元件;转录因子结合位点;生物信息学

期刊名称：黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2021 年 13.0 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; 农林核心（2020版）

摘要： 为了构建猪NLR家族含CARD结构域5 (NOD-like receptor family caspase recruitment domain family domain-containing 5,NLRC5)基因启动子双荧光素酶报告质粒,确认其活性,进而探索其转录调控机制,试验采用PCR方法从猪睾丸细胞(swine testicular cell, ST细胞)中扩增出猪NLRC5基因启动子,将其与pGL3-Basic载体连接,测序正确后将猪NLRC5基因启动子双荧光素酶报告质粒转染至ST细胞中,通过双荧光素酶报告检测试剂盒检测荧光素酶的表达活性,并使用生物信息学软件预测该基因启动子区域的CpG岛、调控元件及转录因子结合位点。结果表明:试验成功构建猪NLRC5基因启动子双荧光素酶报告质粒,该质粒的相对荧光素酶活性极显著高于pGL3-Basic载体(P<0.01)。NLRC5基因启动子区域中存在2个CpG岛,TATA box、CCAAT box和GC box等多种调控元件,以及IRF1、IRF3、STAT1、STAT3、STAT4和NF-κB转录因子结合位点。说明猪NLRC5基因的表达可能受甲基化的影响,同时也可能受顺式作用元件以及干扰素和NF-κB相关转录因子的调控。

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