数字农科院2.0

基于重测序的烟草赤星病抗性关联SNP位点挖掘

文献类型: 中文期刊

作者: 王文静;王凤龙;焦芳婵;孙光军;宋光龙;陈风雷;王卫民;吴晶晶;王晓强

作者机构:

关键词: 烟草赤星病;重测序;SNP

期刊名称:分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2023 年 21 卷 5 期

页码:

收录情况: 北大核心(2020版) ; ; 科技核心(2023版) ; ; 农林核心(2020版)

摘要: 赤星病是烟草上的重要叶部病害,每年给烟草生产造成巨大损失,培育抗赤星病品种是防治烟草赤星病为害的根本措施,而对赤星病抗性关联遗传位点的发掘、鉴定和利用是培育抗赤星病烟草品种的关键基础。本研究利用抗赤星病的烟草材料‘Beinhart 1000-1’和加工品质好但不抗赤星病的烟草品种‘K326’,通过种间杂交和F1代自交分离,创建了‘Beinhart 1000-1’和‘K326’的F2代杂交分离群体。随后,通过赤星病抗病性鉴定,本研究在F2代分离群体中选择了19株抗赤星病材料和19株感赤星病材料,分别进行了基因组DNA提取,并通过BSA法进行了基因组重测序。在重测序数据分析基础上结合表型鉴定结果,本研究鉴定出差异SNP位点约170万个,进行烟草赤星病抗性关联SNP位点分析,找到赤星病抗性相关基因10个,促进了烟草抗赤星病分子育种的发展。

分类号:

  • 相关文献

[1]大豆百粒重相关基因的全基因组发掘分析. 宿洋,杨静,郭勇,杜维俊,邱丽娟. 2021

[2]12种药剂对烟草赤星病菌的抑菌效果研究. 沈宏,张家韬,崔志燕,孙光军,李斌,张永峰,徐传涛,艾永峰,宋光龙,祭秀亭,王晓强. 2020

[3]山东部分地区烟草赤星病病原菌的形态学与分子生物学鉴定. 胡晓莉,蒋彩虹,耿锐梅,赵强,侯烁,张雨生,程立锐,杨爱国,王元英. 2018

[4]烟草赤星病抗性因素遗传的双列分析. 郭永峰,石金开,孔凡玉,王年,王从丽,何京美,朱贤朝. 2000

[5]烟叶面细菌分离筛选及其对烟草赤星病的拮抗作用. 罗坤,罗宽,朱小湘,何昆,黎起秦,黄世文. 2006

[6]三株芽孢杆菌的生防特性研究. 李苗苗,张家韬,崔传斌,孙光军,王东坤,崔志燕,高强,冯超,王凤龙,陈德鑫,王晓强. 2020

[7]烤烟烟碱含量的全基因组关联分析. 孙鑫,文柳璎,尹鹏嘉,罗成刚,樊文强,任民. 2017

[8]桑叶葡萄叶绿体基因组及其特征分析. 杨亚蒙,焦健,樊秀彩,张颖,姜建福,李民,刘崇怀. 2019

[9]黄瓜嫩果皮色基因QTL定位分析. 窦文文,沈镝,麦尔旦·努尔阿伍提,董洪霞,邱杨,李锡香. 2018

[10]烟草航天诱变突变体变异检测及分析. 周世奇,刘东阳,潘旭浩,屈建康,程立锐,任民,晁江涛,张玉,罗成刚. 2019

[11]基于RAD重测序技术开发烟草品种SNP位点. 任民,程立锐,刘旦,蒋彩虹,杨爱国. 2018

[12]长三角地区兼用型鸭全基因组遗传多样性分析. 章双杰,王靖,杨建生,李慧芳,宋卫涛,许金根,华国浩,叶彩芳,林雨鑫,刘怡. 2017

[13]大白菜InDels标记开发及其在剩余杂合体鉴定中的应用. 张志刚,赵智中,李巧云,王晓,刘栓桃,王淑芬,徐文玲,刘贤娴,刘辰. 2016

[14]动物基因组学重测序的应用研究进展. 汪文强,赵生国,马利青,郭继军,马月辉,赵倩君. 2016

[15]动物基因组学重测序的应用研究进展简. 汪文强,赵生国,马利青,郭继军,马月辉,赵倩君. 2016

[16]基于测序技术的畜禽基因组学研究进展. 梁素芸,周正奎,侯水生. 2017

[17]基于重测序的染色体片段代换系定位水稻抽穗期QTL. 王军,朱金燕,陶亚军,周勇,范方军,李文奇,王芳权,仲维功,杨杰,梁国华. 2017

[18]玉米DCL1基因鉴定及其自然等位变异分析. 徐东东,赵永平,王建海,周强,谢传晓. 2015

[19]基于黄瓜基因组重测序的InDel标记开发及其应用. 李斯更,沈镝,刘博,邱杨,张晓辉,张忠华,王海平,李锡香. 2013

[20]长江下游地区地方鸭种全基因组序列测定及遗传多样性分析. 章双杰,王靖,杨建生,李慧芳,宋卫涛,许金根,华国浩,叶彩芳,林雨鑫. 2016

作者其他论文 更多>>