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犬Ⅰ型腺病毒Ⅸ蛋白的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王鹏;廉士珍;刘晓颖;胡博;邓效禹;张蕾;吕爽;王洪海;闫喜军;朱言柱

作者机构：

关键词： 犬Ⅰ型腺病毒; Ⅸ蛋白; 生物信息学; B细胞; 蛋白质空间结构; 抗原决定簇

期刊名称：黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2021 年 18 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; 农林核心（2020版）

摘要： 为了探究犬Ⅰ型腺病毒（CAdV-1）Ⅸ蛋白的理化性质、空间结构与抗原位点,试验以中国农业科学院特产研究所宠物生物制品研发团队实验室分离毒株的Ⅸ蛋白氨基酸序列为研究对象,采用生物信息学方法,利用ProtParam tool、NetPhos 3.1 Server、TMHMM、PSIPRED、SOPMA、Phyre 2和IEDB等在线网站对Ⅸ蛋白的理化性质、磷酸化位点、糖基化位点、跨膜区、信号肽、二级结构、三级结构、抗原决定簇和B细胞抗原决定簇进行预测。结果表明:Ⅸ蛋白含有71个氨基酸,平均吸水系数为-0.399,等电点为9.86。α-螺旋、延伸链、β-转角和无规则卷曲分别占16.90%、35.21%、9.85%和38.03%。Ⅸ蛋白不存在跨膜区和信号肽,存在2个潜在蛋白质抗原决定簇、5个蛋白质磷酸化位点,潜在B细胞抗原决定簇为18～31位。说明本试验初步预测分析得到CAdV-1Ⅸ蛋白的理化性质和抗原决定簇,可为CAdV-1Ⅸ蛋白的分离、提纯提供参考依据,同时为进一步研制基于Ⅸ蛋白的亚单位疫苗提供前期基础。

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