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利用剩余杂合株系定位油菜根系发育主效QTL位点RT.C08

文献类型： 中文期刊

作者： 黄林涛;沙爱华;王新发;顿小玲;匡列琼

作者机构：

关键词： 甘蓝型油菜;根系;剩余杂合系;QTL定位;KASP标记

期刊名称：中国油料作物学报

ISSN： 1007-9084

年卷期： 2022 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2021-2022年度） ; 科技核心（2021版） ; 农林核心（2020版）

摘要： 油菜根系发育主效QTL的发掘与利用，对明确油菜根系发育机制，从根系形态建成的角度为油菜高产育种提供指导具有重要意义。本研究前期通过对一个重组自交系（RIL）群体（中双11×4D122）的QTL扫描，获得了1个控制根系发育的主效QTL位点RT.C08，最高可解释14.1%的根总体积表型变异。在此基础上，利用SNP芯片分型数据挑选出7个覆盖整个区间的剩余杂合单株，并以其构建RHL-F2和RHL-F3分离群体用作定位群体。基于SNP芯片数据和亲本序列差异，本研究在RT.C08的初定位区间开发了10个竞争性等位基因特异性（KASP）标记用于定位群体的基因分型，结合表型和基因型分析，发现剩余杂合系R53、R107和R260分离获得的B基因型（4D122基因型）株系在地上生物量、根鲜重、总根长、根表面积和根体积上优于A基因型（中双11号基因型）株系，这与RT.C08位点增效基因来自4D122一致，其它剩余杂合系未出现这种差异。进一步利用R53和R107的交换株系R53-F3-5和R107-F3-8，最终将RT.C08区间锁定在KASP标记NC8-6和C8-24663之间，且仍有三个KASP标记NC8-7、C8-1和C8-24013与其共分离，该区间在甘蓝型油菜Darmor参考基因组的物理距离约2.24 Mb。利用亲本重测序数据和基因表达谱分析，在此区间内共筛选出66个候选基因，其中BnaC08g21500D（CYCLIN D3）等12个基因已被报道调控根、叶片和/或下胚轴的生长。本研究为油菜优异根系分子标记辅助选择育种和重要基因的克隆奠定了良好的基础。

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