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犬细小病毒北京分离株VP2基因克隆及变异分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王净;李英俊;李刚;史利军

作者机构：

关键词： 犬细小病毒;VP2基因;序列分析

期刊名称：中国兽医学报

ISSN： 1005-4545

年卷期： 2011 年 31 卷 05 期

页码： 649-653

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对北京昌平地区分离的9株犬细小病毒(Canine parvovirus,CPV)进行VP2基因克隆测序,并利用生物信息学软件,将克隆的VP2基因与GenBank公布的国内外部分毒株序列相比较,绘制系统进化树,分析9株CPV VP2蛋白亲水性和抗原指数。结果表明,分离毒株与参考毒株核苷酸和氨基酸同源率在97%以上。通过序列比对与分析,确定其中有8株为New CPV-2a,1株为CPV-2,表明该地区目前主要以New CPV-2a流行为主。9株分离株在进化树上都能找到亲缘关系较近的毒株,没有形成新的分支。9株VP2蛋白亲水性高的区域抗原指数相应就高,不同株之间总体差别很小,主峰相同。

分类号： S852.65

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