2020-2023甘肃猪繁殖与呼吸综合征病毒的基因遗传变异分析
文献类型: 中文期刊
作者: 焦守德;张婧;李平花;王健;韩庆彦;张雨星;魏达礼;王方洲;白兴文;卢曾军;马雪青;孙普
作者机构:
关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒;ORF5;NSP2;ORF3;遗传变异
期刊名称:中国兽医科学
ISSN: 1673-4696
年卷期: 2024 年
页码:
收录情况: 北大核心(2023版) ; ; CSCD(2023-2024年度) ; ; 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2020版)
摘要: 为了了解甘肃地区猪群中猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV) 的流行及遗传变异情况,采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)方法对2020-2023年收集的猪组织样品进行PRRSV ORF5、NSP2和ORF3基因扩增并测序,通过MEGA软件构建遗传进化树进行遗传变异分析。结果显示,共检测了52份猪临床样品,PRRSV核酸阳性率为52%(32/52),成功获得了32条ORF5、15条NSP2和14条ORF3基因序列。ORF5基因遗传进化分析表明,2020-2023年甘肃地区猪群中PRRSV流行毒株中存在美洲型1.5谱系(4株)、1.8谱系(24株)、5.1谱系(2株)、8.7谱系(2株);NSP2基因遗传进化分析表明,获得的15条NSP2序列均为1.8谱系;ORF3基因遗传进化分析表明,获得的14条ORF3序列包括1.5谱系(2株)、1.8谱系(11株)、3.5谱系(1株)。基因核苷酸序列与参考毒株的同源性分别为ORF5 82.3%~99.7%、NSP2 85.9%~90%和ORF3 89.8%~95.7%;基因编码氨基酸序列与参考毒株的同源性分别为ORF5 79.6%~99%、NSP2 83.4%~87.7%和ORF3 85.1%~94.5%。ORF5基因编码的GP5蛋白的信号肽区、高变区、细胞表位区等区域均存在不同程度的变异,其中5株毒株的第33位氨基酸出现了缺失;15株NSP2蛋白氨基酸序列的缺失模式与NADC30株一致。上述结果表明,当前甘肃地区猪群中PRRSV呈现以1.8毒株谱系为优势的美洲型多谱系共循环流行,这对甘肃地区防控PRRSV提供了重要的流行病学数据。
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