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中国盖塔病毒Ⅲ型变异株的全基因组序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 许浒;冯子萱;龚帮俊;张思钰;李超;李金昊;郭镇洋;张雪莉;石佳豪;宋紫雨;彭金美;王倩;周国辉;汤艳东;安同庆;蔡雪辉;冷超粮;张洪亮;田志军

作者机构：

关键词： 盖塔病毒;III型变异株;分子特征

期刊名称：中国预防兽医学报

ISSN： 1008-0589

年卷期： 2025 年 47 卷 3 期

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2025-2026年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2024版）

摘要： 盖塔病毒(GETV)是一种广泛分布于亚洲和泛太平洋国家的蚊媒RNA病毒,其感染宿主众多,对猪致病力强。2024年7月至8月,河南省和湖北省的8个规模化养猪场2个月内集中出现哺乳仔猪发烧、腹泻和死亡等临床症状,仔猪发病率约为10%~20%,死亡率高达100%。为探究疾病暴发的原因,本研究在8个猪场分别采集猪肺脏、脾脏、肠道组织,每个猪场合为1个样品,共8份临床样品。采用RT-qPCR和qPCR方法鉴定各疑似病原,结果显示8份样品中非洲猪瘟病毒(ASFV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪瘟病毒(CSFV)、猪圆环病毒2型(PCV2)、PCV3和猪伪狂犬病毒(PRV)均为阴性。进一步利用RT-PCR在8份样品中扩增出GETV的Nsp3和E2基因,8份样品均为GETV阳性,确定本次疫情由GETV引起。测序获得8份样品的Nsp3和E2基因序列,选取其中1株(HN1)分8段扩增各基因序列,利用SeqMan拼接获得HN1株全基因组序列。参照GenBank中Group I-Group IV型GETV代表株的E2基因、Nsp3基因和全基因组序列,利用Megalign软件分析本研究鉴定的GETV与各型GETV代表株E2序列的相似性；利用MEGA7.0构建上述GETV E2基因和全基因组序列(HN1株)的遗传进化树,分析其遗传变异情况；利用Megalign软件分析各型GETV Nsp3氨基酸突变特征。E2基因编码氨基酸序列相似性比对结果显示,本研究鉴定的各株GETV之间E2氨基酸序列的相似性均达100%,同时与Group Ⅲ型代表株GETVV1株E2基因序列的相似性较高(98.5%~98.6%)。基于E2基因和全基因组序列构建的进化树结果显示,本研究鉴定的GETV均属于Group Ⅲ型(Ⅲ型),形成了一个独立分支,将其命名为GETV Ⅲ型变异株。Nsp3氨基酸序列比对分析发现,GETV Ⅲ型变异株与其他GETV相比在S^(329)、T/I^(381)和G^(503)处存在3个特征性氨基酸突变,可以作为鉴别GETV Ⅲ型变异株的分子特征,且特征性氨基酸突变均位于Nsp3的高变结构域(HVD)内,可能与GETV Ⅲ型变异株毒力增强有关。本研究首次鉴定了GETV Ⅲ型变异株,并首次报道GETV Ⅲ型变异株在我国河南省和湖北省引起疫病的集中暴发,对了解我国GETV流行现状以及对其感染的防控均具有重要的指导意义。

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