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水牛ApoB基因多态性与泌乳性状关联分析

文献类型： 中文期刊

作者： 林雨昕;曹家瑄;孙晖;李俊;李华钊;吴祺鹏;邓廷贤;杨利国;滑国华

作者机构：

关键词： 水牛;ApoB;泌乳性状;性状关联分析;基因多态性

期刊名称：基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2022 年 41 卷 6 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2023版）

摘要： 本研究旨在探究水牛(Bubalus bubalis)载脂蛋白B基因(ApoB)在地中海水牛群体中的遗传多态性,并与地中海水牛泌乳性状进行关联分析,筛选水牛产奶性状分子标记。本研究以350头地中海纯种奶水牛为研究对象,利用直接测序法和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)法筛选基因多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与基因分型,并进一步分析单倍型与泌乳性状的相关性。结果显示,在地中海水牛群体ApoB基因中筛选到10个SNPs,分别位于启动子(g.-1718A>G、g.-1823G>C和g.-2063A>C)、第7内含子(g.8105G>A)、第26内含子(g.30643G>A)、第5外显子(g.5903G>A)、第26外显子(g.30879T>C、g.33638A>C和g.37375G>A)和第29外显子(g.40787A>G)区域。10个SNPs位点多态信息含量均大于0.25且小于0.5,属于中度多态。其中g.-1718A>G、g.-1823G>C、g.-2063A>C、g.37375G>A和g.40787A>G突变位点与地中海水牛乳蛋白率显著相关,g.5903G>A和g.40787A>G位点与地中海水牛乳脂率显著相关,g.37375G>A与地中海水牛270天乳蛋白量和乳脂量显著相关。单倍型Block1(g.-1718A>G、g.-1823G>C和g.-2063A>C)与270天乳蛋白量和乳蛋白率显著相关；单倍型Block2(g.30643G>A和g.33638A>C)与270天乳脂含量、乳脂率、270天乳蛋白量以及乳蛋白率显著相关；单倍型Block3(g.37375G>A和g.40787A>G)与乳蛋白率显著相关；g.33638A>C、g.37375G>A、g.40787A>G以及单倍型Block2和Block3突变型蛋白质理化性质和二级结构发生改变。本研究共筛选到6个SNPs和3个单倍型Block与水牛泌乳性状显著相关,其中单倍型Block2的H3H3为最优单倍型,可作为水牛产奶性状潜在分子标记。

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