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全基因组选择信号揭示绵羊毛囊发育及脱毛性状相关的候选基因

文献类型： 中文期刊

作者： 雷志惠;张利平;赵洪昌;朱韶华;卢曾奎;郭婷婷;孙渭博;赫雪;岳耀敬

作者机构：

关键词： 绵羊;SNP芯片;选择信号;Fst;θπ Ratio

期刊名称：畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2022 年 53 卷 02 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2021-2022年度） ; 科技核心（2021版） ; 农林核心（2020版）

摘要： 利用全基因组选择信号研究不同羊毛类型绵羊的群体结构及遗传分化程度,以挖掘与毛囊发育及脱毛性状相关的候选基因。本研究以3种羊毛类型的21个品种共290只绵羊群体为研究对象,利用Illumina Ovine SNP 50K芯片基因分型数据,基于群体分化指数Fst和核苷酸多样性比值θπRatio方法对无绒毛型、细毛型和中毛型绵羊进行选择信号检测。将Fst和θπRatio的top 5%作为阈值检测受到强烈选择的SNPs位点并进行注释。结果表明,SOX18、ALX4、FGF1和LRP4等与毛囊发育及脱毛性状相关的基因受到强烈选择。本研究通过Fst和θπRatio两种方法检测出与毛囊发育周期、羊毛形成以及毛囊和皮脂腺部分细胞相关的重要基因,这将为进一步研究绵羊重要经济性状形成的机制提供有意义的参考。

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