苦荞TCP转录因子基因FtTCP2和FtTCP19的克隆和表达分析
文献类型: 中文期刊
作者: 马超;刘代玲;程剑平;周美亮;姚鑫;吴伟娇;白青;阮景军
作者机构:
关键词: 苦荞;FtTCP2和FtTCP19;基因克隆;生物信息学分析;表达分析
期刊名称:分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2023 年
页码:
收录情况: 北大核心(2020版) ; ; 科技核心(2023版) ; ; 农林核心(2020版)
摘要: TCP(Teeosinte branched I, Cycloidea, Proliferating Cell Factors 1和2)转录因子是植物特有转录因子家族,在植物生长发育和逆境胁迫中都有着很重要作用。为揭示苦荞(Tartary buckwheat)转录因子FtTCP2和FtTCP19的表达特征和功能,本研究以苦荞‘川荞2号’为材料,对其进行基因克隆、生物信息学分析并采用实时荧光定量(RT-qPCR)技术对FtTCP2和FtTCP19基因在苦荞不同组织内响应胁迫及激素的表达模式进行分析。结果显示,苦荞FtTCP2和FtTCP19基因编码蛋白序列(CDS)全长分别为1113 bp和813 bp,分别编码370、270个氨基酸,亚细胞定位预测均位于细胞核中,且无跨膜区和信号肽。系统进化分析表明,苦荞FtTCP2与马铃薯(Solanum tuberosum)和番茄(Solanum lycopersicum)的亲缘关系最近;苦荞FtTCP19与菊薯(Smallanthus sonchifolius)和莴苣(Lactuca sativa)的亲缘关系最近。基因表达分析显示,FtTCP2和FtTCP19基因在不同非生物胁迫及激素处理条件下的表达具有时空特异性,在不同组织内有明显的上调或下调趋势。本研究发现了2个FtTCP基因在苦荞平衡胁迫调控中扮演重要角色,为以后探索苦荞TCP转录因子家族在逆境胁迫中的响应机制提供参考。
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