苦荞FtGST基因的克隆、生物信息学分析以及逆境胁迫下表达分析
文献类型: 中文期刊
作者: 白青;江燕;阮景军;周美亮;姚鑫;马超;吴伟娇;程剑平
作者机构:
关键词: 苦荞;FtGST;生物信息学分析;表达分析
期刊名称:分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2023 年
页码:
收录情况: 北大核心(2020版) ; ; 科技核心(2023版) ; ; 农林核心(2020版)
摘要: 谷胱甘肽S-转移酶(Glutathione S-transferases, GST)是一类多功能酶,参与抗氧化应激和细胞解毒。本研究通过同源克隆的方法获得苦荞FtGST基因的CDS序列,序列全长654 bp,编码217个氨基酸,生物信息学分析结果显示,其蛋白理论相对分子质量为24.88 kD,理论等电点为5.70;亚细胞预测定位于叶绿体,不存在跨膜区及信号肽,为非分泌蛋白;不含糖基化位点,含有17个磷酸化位点,为亲水性蛋白质。保守结构域分析结果表明,FtGST蛋白含有N端和C端,属于GST蛋白的Phi亚家族。系统进化分析表明,苦荞FtGST与荷花(Nelumbo nucifera)的亲缘关系最近。苦荞FtGST基因时空表达分析结果显示,FtGST基因在不同非生物胁迫下的表达具有时空特异性,冷、全黑暗和盐胁迫处理均可显著上调该基因的表达。这些分析结果为苦荞谷胱甘肽S-转移酶生物合成及其功能的进一步研究提供一定的理论与实践依据。
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