牛乳头瘤病毒基因2型流行株全基因组的克隆及序列分析
文献类型: 中文期刊
作者: 贺志昊;孟庆玲;乔军;刘昱成;杨海波;王国超;才学鹏;陈创夫
作者机构:
关键词: 牛乳头瘤病毒基因2型;衣壳蛋白L1基因;全基因组序列;遗传进化分析
期刊名称:西北农业学报
ISSN: 1004-1389
年卷期: 2013 年 22 卷 11 期
页码: 183-188
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了解牛乳头瘤病毒(Bovine Papillomavirus,BPV)新疆流行株基因型及其基因组遗传变异情况,用乳头瘤病毒L1基因简并引物FAP59/FAP64对新疆沙湾县奶牛皮肤肿瘤组织样品进行PCR扩增,测序后确定,BPV基因型;设计6对BPV基因型特异性引物,经扩增、测序、拼接后获得BPV流行株全长基因组序列。L1基因序列分析表明,BPV2-SW01流行株为BPV-2基因型;该毒株基因组全长7 944bp,包括E6、E7、E1、E8、E2、E4、E3、E5、L2和L1 10个开放阅读框(ORF)。遗传进化树分析显示,BPV2-SW01归于Delta乳头瘤病毒属,与BPV-1和BPV-13进化关系最近。
分类号: S852.65
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