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用3'RACE方法扩增并克隆口蹄疫病毒基因组3'末端序列

文献类型： 中文期刊

作者： 刘光清;刘在新;谢庆阁

作者机构：

关键词： 3'RACE;口蹄疫病毒;3'端非编码区;Poly(A);序列分析

期刊名称：中国兽医学报

ISSN： 1005-4545

年卷期： 2003 年 23 卷 6 期

页码： 524-526

收录情况： CSCD

摘要： 应用3'RAcE方法扩增并克隆了口蹄疫病毒(FMDV)(JH99株基因组3'端真实序列。测序结果表明，所扩增的 目的基因片段长1 500 nt，包括3D基因部分序列、3'端非编码区(Non-Coding Region，NCR)和Poly(A)尾巴，其中3' NCR位于终止密码子TAA之后，长93 nt，Poly(A)尾序列至少含有56个A。与参考毒株进行序列比较，结果显示， OH99株与OTY Tw／97株的核苷酸同源性较高，为91．4％，而与OlK、CHINA99、A12等毒株的核苷酸同源性较低,其同源性分别为68．1％、71．O％、70．2％。3'NCR的末端存在保守性较高的基序：CCCTCAGATG，TTTTCCC- CGCTTCcT。本研究为进一步研究FMDV基因组的功能、构建OH199株的反向遗传操作系统奠定了基础。

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