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旋毛虫半胱氨酸蛋白酶抑制剂基因TsCystatin1的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 姚菊霞;李文卉;盖文燕;曲自刚;谢志宙;王艳华;张德林;付宝权

作者机构：

关键词： 旋毛虫;半胱氨酸蛋白酶抑制剂;克隆;序列分析

期刊名称：中国兽医科学

ISSN： 1673-4696

年卷期： 2011 年 06 期

页码： 569-574

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究旋毛虫半胱氨酸蛋白酶抑制剂的功能,应用电子克隆的方法从GenBank EST数据库获得1个旋毛虫半胱氨酸蛋白酶抑制剂基因(TsCystatin1)的部分cDNA序列,据此设计引物,并以旋毛虫新生幼虫总RNA为模板,进行反转录及PCR,克隆到该基因的完整开放阅读框序列,利用生物信息学软件对其进行了预测分析。结果表明,TsCystatin1 cDNA序列含有一个由666个核苷酸组成的开放阅读框架,编码由221个氨基酸残基组成的多肽,蛋白分子质量理论值为24.3ku,理论等电点为4.44。TsCystatin1第1～25位氨基酸残基为信号肽序列,具有半胱氨酸蛋白酶抑制剂的保守序列QVVAG,其C末端具有3处N-糖基化位点以及4个链内二硫键所需的半胱氨酸残基。该蛋白的二级结构中α螺旋占18.6%,β折叠占23.5%,其余57.9%为转角。结构域分析表明,该蛋白具有一个半胱氨酸蛋白酶抑制剂样结构域,属于半胱氨酸蛋白酶抑制剂家族2,与其他线虫半胱氨酸蛋白酶抑制剂的同源性较高。

分类号： S852.7

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