数字农科院2.0

光敏色素B基因(PHYB)启动子突变及与大白菜开花时间的关联分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘栓桃;张志刚;李巧云;王淑芬;赵智中;卢金东;张晓燕;徐文玲;刘贤娴;付卫民

作者机构：

关键词： 大白菜;光周期依赖;开花期;PHYB启动子;突变

期刊名称：农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2014 年 22 卷 07 期

页码： 65-73

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 光敏色素B(phytochrome B,PHYB)是植物光周期依赖开花途径的关键调控因子之一。本研究对极端晚花和早花大白菜(Brassica rapa L.ssp.pekinensis)自交系06-247与He102的PHYB全基因组序列进行了生物信息学分析。结果表明,二者全长分别是5 986和5 528 bp,均与数据库中Chiifu-401的同源序列有不同程度的差异,表明二者均是大白菜PHYB基因的突变体,并命名为BraphyB1(GenBank登录号:KJ866947)和BraphyB2(GenBank登录号:KJ866948)。二者之间有476个插入/缺失(Inserts/Deletions,InDels)和57个SNPs。启动子区有473个InDels和31个SNPs、编码区有3个InDels和26个SNPs。InDels主要体现为phyB2在启动子区、5'非翻译区和编码区分别缺失445、18和3 bp。phyB2启动子缺失的445bp中包含两个TATABOX4和两处成髓细胞血症(myeloblastosis,MYB)类转录因子结合基序,一处GA响应元件。开发了鉴定phyB1/phyB2中445 bp InDel突变的共显性标记phyB1-762/phyB2-317,用该标记检测了以06-247与He102为亲本杂交构建的F2群体,利用F2代群体植株对抽薹开花时间与标记进行了关联分析,结果表明,phyB1-762/phyB2-317分别与晚花/早花表型显著关联(P<0.05)。荧光定量RT-PCR显示,PHYB基因在He102各个发育阶段的表达水平均显著低于06-247(P<0.01)。上述结果表明,大白菜PHYB基因启动子InDel是造成PHYB基因表达差异和开花期改变的主要原因之一。本研究为系统研究PHYB基因在转录、翻译、蛋白结构等水平突变对大白菜开花时间影响的分子机制提供了线索。

分类号： S634.1`Q943.2

  • 相关文献

[1]油菜开花期QTL定位和候选基因分析. 魏雅琪,危文亮,刘道敏,张江江,詹杰鹏,师家勤,王新发,刘贵华. 2019

[2]抽穗开花期耐热性水稻恢复系鉴定筛选. 文绍山,张林,焦峻. 2018

[3]开花期水分胁迫对水稻生长及稻米品质的影响. 郑传举,李松. 2017

[4]早季超级稻品种开花期抗高温特性研究. 林贤青,朱德峰. 2011

[5]水稻开花期高温胁迫的研究概述. 陶龙兴,沈波,符冠富,虞智群,李玲巧,王琪. 2009

[6]干旱胁迫和正常灌溉条件下玉米开花相关性状的QTL分析. 张吉民,刘成,石云素,宋燕春,白宝璋,黎裕,王天宇. 2004

[7]杂交中稻开花期高温对结实率影响及其与组合间库源结构和开花习性的关系. 张林,熊洪,朱永川,刘茂,蒋鹏,郭晓艺. 2015

[8]不同钾水平对温室番茄生长、产量和品质的影响. 宁秀娟,余宏军,蒋卫杰,刘啸然,杨学勇. 2011

[9]对两个亚热带优质蛋白玉米群体的适应性混合选择研究——Ⅰ.开花期性状的直接选择响应. 张世煌,石德权,徐家舜,杨引福,康继伟,汪黎明. 1995

[10]开花期复水对受旱冬小麦的补偿效应研究. 陈晓远,罗远培. 2001

[11]籼稻开花期耐热性鉴定与QTL定位分析. 刘周,唐启源,李飞,U.A.Kapila Siri Udawela,项超,高用明,石英尧. 2015

[12]干旱胁迫和正常灌溉条件下玉米产量性状的QTL分析. 王阳,刘成,王天宇,石云素,宋燕春,黎裕. 2007

[13]我国水稻常用保持系穗期耐旱性测评及育性分析. 陶龙兴,符冠富,宋建,乐明凯,王熹. 2009

[14]不同水稻品种花期耐旱性评价. 李松,张玉屏,朱德峰,林贤青,陈惠哲,向镜. 2013

[15]甘蓝类作物抽薹期及开花期数量性状的研究进展. 陈书霞,房玉林,王晓武,程智慧,方智远,孙培田. 2005

[16]黄麻选系材料不同光周期处理下的观察与筛选(英文). 程新奇,王文龙,黎宇. 2001

[17]俄罗斯大豆品种种植在北京地区的农艺性状表现. 王岚,王连铮. 2015

[18]结球甘蓝自交系抽薹与开花性状配合力及遗传力分析. 李梅,刘玉梅,方智远,杨丽梅,庄木,张扬勇,孙培田,孙振英. 2009

[19]160个玉米自交系光周期敏感性鉴定. 谢传晓,王振华,於琍,张玮,李明顺,李新海,程备久,张世煌. 2008

[20]芒果花期饲放授粉昆虫能提高产量. 何新华. 1995

作者其他论文 更多>>