以湖南和湖北大豆[Glycine max(L.)Merr.]为例分析影响遗传多样性评价的因素
文献类型: 中文期刊
作者: 关媛;鄂文弟;王丽侠;关荣霞;刘章雄;常汝镇;曲延英;邱丽娟
作者机构:
关键词: 大豆;遗传多样性;SSR标记;Shannon指数;期望杂合度;等位变异数;取样量
期刊名称:作物学报
ISSN: 0496-3490
年卷期: 2007 年 33 卷 03 期
页码: 461-468
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 以不同来源大豆种质为材料进行基因组SSR分析,探讨大豆遗传多样性研究方法,旨在为科学评价大豆种质资源提供参考。当取样比例相同时,湖北大豆的遗传丰富度显著高于湖南大豆,但两省大豆遗传多样性指数之间没有显著差异。当取样量相同时,利用随机取样法比较,湖南大豆的遗传多样性显著高于湖北,而利用聚类取样比较,两省大豆的遗传多样性没有显著差异。在遗传多样性指数相同情况下,湖北大豆的遗传丰富度显著高于湖南大豆。取样数与三个遗传多样性评价参数(等位变异数、Shannon指数、He)之间均达到显著和极显著相关。以湖南大豆为例,估算出在大豆SSR遗传多样性分析中,至少需要50-60个样本,即占总体9.0%-10.8%的取样比例,才能代表总体的遗传变异。提出在评价大豆遗传多样性时,应用大豆样本数对其遗传多样性指数计算公式进行修正,建议将Shannon指数计算公式改为H=-lnN∑PilnPi(N为样本数)。根据修正公式分析,结果表明,湖北大豆的遗传多样性高于湖南大豆。
分类号: S565.1
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