甘蔗苯丙氨酸解氨酶基因(PAL)的克隆和表达分析
文献类型: 中文期刊
作者: 黄杏;莫凤连;田丹丹;杨丽涛;李杨瑞;陈保善
作者机构:
关键词: 甘蔗;苯丙氨酸解氨酶;基因克隆;表达分析
期刊名称:中国农业科学
ISSN: 0578-1752
年卷期: 2013 年 46 卷 14 期
页码: 2856-2868
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】克隆甘蔗的苯丙氨酸解氨酶基因(PAL),分析其序列特征及其在不同组织和5种胁迫条件下的表达情况,为此基因在甘蔗抗逆育种中的应用提供理论支撑。【方法】利用串联飞行时间质谱仪对差异表达蛋白质进行质谱鉴定分析,通过RT-PCR和RACE技术从甘蔗品种新台糖22号(ROC22)中克隆PAL,以生物信息学方法对其序列进行预测分析,利用real-time PCR分析PAL在不同组织和不同胁迫条件下的表达特性。【结果】克隆获得甘蔗PAL,命名为ScPAL,GenBank登录号为KC172559。该cDNA全长2 590 bp,含有1个2 115 bp的完整开放阅读框(ORF),编码704个氨基酸。序列分析表明,其包含典型的PAL酶活性中心序列(GTITASGDLVPLSYIA),与其它植物的PAL蛋白有很高的相似性。系统进化树分析显示,甘蔗ScPAL与高粱的PAL蛋白亲缘关系较近。real-time PCR分析表明PAL为组成型表达,在根中的表达量最高,是叶中表达量的66倍。其在低温(4℃)、聚乙二醇(PEG)、NaCl和H2O2四种外源胁迫下均诱导表达,但表达模式不同。【结论】从甘蔗品种ROC22中克隆获得苯丙氨酸解氨酶基因(ScPAL),是典型的PAL家族成员,推测其参与了甘蔗抗黑穗病过程,且在甘蔗抗寒、抗旱和抗盐胁迫过程也起到某种作用。
分类号: S566.1
- 相关文献
[1]甘蔗抗坏血酸过氧化物酶基因ScAPX1的克隆和表达分析. 张保青,邵敏,黄玉新,黄杏,宋修鹏,陈虎,王盛,谭秦亮,杨丽涛,李杨瑞. 2019
[2]甘蔗蔗糖转运蛋白SoSUT5基因克隆、表达及功能鉴定. 牛俊奇,苗小荣,王道波,杨丽涛,李杨瑞. 2018
[3]甘蔗可溶性酸性转化酶(SoSAI1)基因的克隆及表达分析. 王爱勤,黄静丽,朱惠,李杨瑞,杨丽涛. 2013
[4]甘蔗NADP异柠檬酸脱氢酶基因(SoNADP-IDH)的克隆与表达分析. 杨丽涛,王盛,张小秋,李杨瑞. 2015
[5]甘蔗类异黄酮还原酶(IRL)基因的克隆与表达分析. 张小秋,邵敏,朱惠,杨丽涛,李杨瑞. 2014
[6]壳寡糖诱导甘蔗叶多酚与防御酶活性的变化. 靳晓芸,邓光辉,丘立杭,邹成林,李杨瑞. 2011
[7]干旱胁迫下甘蔗叶类黄酮及相关酶活性的变化. 李杨瑞,杨丽涛,韦雪雪,丘佩玲. 2009
[8]乙烯利对聚乙二醇胁迫下甘蔗叶类黄酮及相关酶活性的影响. 李杨瑞,杨丽涛,丘佩玲,韦雪雪,黄颖琴. 2009
[9]枣果实中苯丙氨酸解氨酶基因的克隆及序列分析. 谭洪花,曹尚银,房经贵,薛华柏,王纪贵,李登科,郭俊英,刘丽,司鹏. 2011
[10]甘蔗S-腺苷甲硫氨酸合成酶基因(ScSAM)的克隆及表达. 张保青,黄杏,杨丽涛,李杨瑞. 2014
[11]甘蔗Cu/Zn-SOD的克隆和表达分析. 张保青,黄杏,樊艳姣,杨丽涛. 2013
[12]茄子紫色形成的分子研究进展. 张映,赵悦琪,陈钰辉,连勇,刘富中. 2019
[13]柑橘4个WRKY转录因子基因的克隆及其响应柑橘溃疡病菌侵染的表达分析. 周鹏飞,贾瑞瑞,陈善春,许兰珍,彭爱红,雷天刚,李强,陈敏,白晓晶,邹修平,何永睿. 2017
[14]马铃薯stuProT1.2基因的克隆与非生物胁迫的表达分析. 王明,谢洁,丁红映,熊兴耀,王万兴,秦玉芝. 2019
[15]甜高粱可溶性酸性转化酶基因(SAI-1)cDNA全长克隆及表达分析. 聂元冬,刘洋,顿宝庆,王智,钟海丽. 2014
[16]西瓜抗根结线虫相关基因的克隆与表达分析. 薛莹莹,邓云,刘君璞,徐小军,朱迎春,安国林,李卫华,孙德玺. 2015
[17]茶尺蠖类免疫球蛋白基因EoHML的克隆和表达分析. 余玉庚,袁志军,殷坤山,付建玉,肖强. 2015
[18]‘红巴梨’果皮UFGT基因的克隆及表达分析. 李俊才,李天忠,王志刚,李宝江. 2010
[19]燕麦葡聚糖合酶基因AsCSLH的克隆及特征分析. 吴斌,张宗文. 2011
[20]独一味苯丙氨酸解氨酶基因的克隆与表达分析. 乔枫,罗桂花,耿贵工,金兰,陈志. 2013
作者其他论文 更多>>
-
糙皮侧耳菌丝体液体发酵制备维生素D2条件的优化
作者:何孟欣;彭晴;徐小轻;田丹丹;弓雨欣;熊小艳;石波;乔宇
关键词:糙皮侧耳;菌丝体;UV-B;麦角甾醇;VD2
-
槐米制备槲皮素及其与粘杆菌素联用对沙门氏菌的作用
作者:熊小艳;田丹丹;弓雨欣;乔宇;徐小轻;何孟欣;石波;彭晴
关键词:槲皮素;槐米;黑曲霉;粘杆菌素;沙门氏菌;协同抑制
-
共培养干酪乳杆菌NA-2和鼠李糖乳杆菌LGG对抑菌活性的影响
作者:施琳波;彭晴;徐小轻;张宇微;杨硕;田丹丹;何孟欣;石波;乔宇
关键词:共培养;乳酸菌;抑菌;条件优化
-
大肠杆菌O157∶H7生物被膜状态下基因表达分析
作者:马蓝;彭晴;徐小轻;杨硕;张宇微;田丹丹;施琳波;石波;乔宇
关键词:大肠杆菌;生物被膜;转录组;差异基因;富集分析
-
三种益生芽孢杆菌制备纳米硒能力研究
作者:张鹏博;彭晴;乔宇;徐小轻;张宇微;田丹丹;黄英;马蓝;石波
关键词:纳米硒;阿氏芽孢杆菌;解淀粉芽孢杆菌;凝结芽孢杆菌
-
广西甘蔗螟虫发生概况和动态变化
作者:吴延勇;李傲梅;张小秋;梁永检;李杨瑞;宋修鹏;吴建明
关键词:甘蔗;螟虫;发生规律;防治策略
-
桂糖甘蔗新品系黑穗病抗性鉴定及结果分析
作者:经艳;周会;刘昔辉;谭芳;张小秋;张荣华;宋修鹏;李杨瑞;颜梅新;雷敬超;覃振强;罗亚伟;李冬梅;韦金菊
关键词:甘蔗;黑穗病;抗性鉴定;人工接种;自然感病
