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粪产碱菌nif H,nif D和部分nif K的克隆、定位及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张海予;萧凤回;朱新生;林敏;方宣钧;尤崇杓;萧凤回

作者机构：

关键词： 粪产碱菌;固氮酶基因;克隆;序列分析

期刊名称：中国科学C辑:生命科学

ISSN： 1006-9259

年卷期： 1997 年 06 期

页码： 14-18

收录情况： CSCD

摘要： 提取粪产碱菌(Alcaligenes faecalis)总DNA,经限制性内切酶酶切和琼脂糖凝胶电泳,以含肺炎克氏杆菌(Klebsiella pneumoniae)nif H和nif H-D基因的DNA片段为探针进行Southern杂交,筛选出与nif HDK同源的4.6kb片段,克隆到pBluesript SK~+载体上,构建了重组质粒pBZl.经亚克隆、酶切、DNA序列分析后发现,粪产碱菌具有与其它固氮菌相似的结构特征,其nif HDK共用1个启动子,具有上游激活序列UAS,RNA聚合酶σ~(54)因子识别序列、1个A-T富集区和SD序列.nifH和nif D的阅读框架分别为888和1476bp,GC含量各为61.6%和60.2%.nifH-nif D和nif D-nif K的基因间隔区长度分别为101和105bp,各存在1个7bp的反向重复和1个SD序列.由阅读框架(ORF)推导的铁蛋白和钼铁蛋白α亚基的氨基酸序列与其它固氮菌相比有较高的同源性,高度保守的氨基酸残基所处的位置也很相似.同源性比较说明,粪产碱菌与棕色固氮菌(Azotobacter vinelandii)同源性最高.

分类号： Q78

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