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基于通路分析方法诠释肉鸡体重性状全基因组关联研究

文献类型: 中文期刊

作者: 王杰;刘璐;刘杰;赵桂苹;刘冉冉;郑麦青;文杰

作者机构:

关键词: SRT;通路;GWAS;体重;肉鸡

期刊名称:畜牧兽医学报

ISSN: 0366-6964

年卷期: 2017 年 48 卷 5 期

页码: 810-817

收录情况: 北大核心(2020版) ; CSCD(2020-2021年度) ; 农林核心(2020版) ; 科技核心(2020版)

摘要: 本研究旨在通过对体重和日增重进行基于通路的关联分析,以期获得影响体重和日增重的信号通路。对北京油鸡与科宝肉鸡F2资源群体14、28、56、93日龄体重及0~14、14~28、28~56、56~93日龄日增重分别进行全基因组关联分析,利用关联分析获得的显著性SNP位点进行基于通路的关联分析(SNP ratio test)。结果表明,14日龄体重与类固醇激素的生物合成相关联(P<0.05),56日龄体重与烟酸/烟酰胺的代谢相关联(P<0.05),93日龄体重与糖酵解/糖异生相关(P<0.05),且各日龄体重性状均与氨基酸的代谢过程相关联(P<0.05)。在增重最快的42~56日龄,与日增重相关的SNP富集到的通路最多,这些通路主要集中在TCA循环、类固醇合成、类固醇激素的生物合成、氧化磷酸化、磷酸肌醇代谢、甘油磷脂代谢等过程。在肉鸡体重迅速增长阶段类固醇激素的生物合成起到了重要作用,且氨基酸代谢过程与日增重显著相关。

分类号: S813.2

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