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雷蒙德氏棉SWEET基因家族的全基因组鉴定和进化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 陈慧敏;李威;马雄风;裴小雨;刘艳改;贺昆仑;张飞;张文生;王振玉;杨代刚;胡守林

作者机构：

关键词： 雷蒙德氏棉;SWEET基因家族;染色体定位;基因结构;进化分析

期刊名称：中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2017 年 25 期

页码： 13-21

摘要： 为了探索SWEET基因家族在棉花中的分布和作用,基于二倍体D基因组雷蒙德氏棉基因组数据,利用生物信息学方法对SWEET基因家族完成了全基因组水平的鉴定,并进行了系统发育、基因结构、染色体定位和跨膜结构域分析。共获得31个雷蒙德氏棉SWEET基因,分散或成簇分布在11条染色体上,分为3个不同功能的亚家族;跨膜结构域预测显示大部分雷蒙德氏棉SWEET基因含7个跨膜结构域,少部分含6或7个跨膜结构域;基因结构分析显示除GrSWEET6、GrSWEET7、GrSWEET9、GrSWEET19含4个内含子外,其余27个SWEET基因均含有5个内含子。这些结果将为进一步深入研究SWEET基因在棉花生长发育中功能奠定坚实的数据基础。

分类号： S562

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