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模拟增温下短花针茅实时荧光定量内参基因的筛选及验证

文献类型： 中文期刊

作者： 高金玉;郭慧琴;曹路;韩冰

作者机构：

关键词： 模拟增温;短花针茅;实时荧光定量PCR;内参基因

期刊名称：草地学报

ISSN： 1007-0435

年卷期： 2017 年 5 期

页码： 1020-1028

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2020-2021年度） ; 农林核心（2020版） ; 科技核心（2020版）

摘要： 本研究以荒漠草原植物短花针茅(Stipa breviflora)为材料,在模拟增温处理下,通过q RT-PCR试验分析9个候选内参基因的表达稳定性,运用Delta-CT法,ge Norm,norm Finder,Bestkeeper软件及Ref Finder在线工具进行候选内参基因的稳定性分析。经普通PCR剔除3个内参基因后,6个候选内参基因表达稳定性由高到低排序为:TLF,18 s r RNA,APRT,TUBα,EF-1α,Actin2。以TLF作为内参基因,在模拟增温下短花针茅转录组数据库中随机选择5个基因进行验证。q RT-PCR结果表明,5个验证基因在增温与对照之间的相对表达量存在倍率变化,且与转录组测序中的变化趋势一致,从而确定TLF为短花针茅增温处理下的最佳内参基因。

分类号： S54

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