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犬瘟热病毒AH株全基因组序列测定及其分子特征

文献类型： 中文期刊

作者： 刘柱;李丹丹;李琦;宫晓华;缪秋红;李传峰;陈宗艳;张淼涛;刘光清

作者机构：

关键词： 犬瘟热病毒;全基因组;序列分析

期刊名称：中国动物传染病学报

ISSN： 1674-6422

年卷期： 2017 年 25 卷 2 期

页码： 1-8

收录情况： 北大核心（2020版） ; 农林核心（2020版） ; 科技核心（2020版）

摘要： 本研究对犬瘟热病毒(Canine distemper virus,CDV)安徽分离株(CDV-AH株)的全基因组序列进行了测定和分析。根据GenBank上已发表的部分CDV基因组全长序列设计了8对特异性引物,RT-PCR方法分段扩增出CDV-AH株的全基因组序列。采用DNAStar软件和MEGA软件对CDV-AH株与其他CDV毒株的基因序列进行了比对和分析,并绘制系统进化树。结果显示,CDV-AH株全长15 690 bp,编码6种结构蛋白(N、P、M、F、H和L),与CDV-PS株核苷酸序列同源性最高,为98.8%,而与CDV-1以及Onderstepoort等疫苗株的序列同源性较低,为92.1%。CDV-AH株在保守区域出现15处氨基酸突变,这些突变对其所编码蛋白结构和功能的影响需要进一步研究。基于H基因序列的系统进化分析表明,CDV-AH株与其他CDV野毒株共同形成一个拓扑群,属于亚洲Ⅰ型。

分类号： S852.659.5

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