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湖羊卵巢不同发育阶段的miRNA鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 解领丽;李嫒;黄万龙;张秀秀;苗向阳

作者机构：

关键词： miRNA;卵巢;发育;功能注释;绵羊

期刊名称：畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2019 年 7 期

页码： 1396-1404

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2020-2021年度） ; 农林核心（2020版） ; 科技核心（2020版）

摘要： 旨在分析不同发育阶段绵羊卵巢组织中miRNA的表达水平,了解miRNA表达及其调控机理.本研究采用转录组测序技术鉴定1和8月龄湖羊卵巢组织中的miRNA,运用生物信息学方法对差异表达的miRNA进行靶基因预测,并对靶基因进行GO和KEGG功能注释,筛选参与卵巢发育的miRNAs.结果显示,6个样品中检测到的已知miRNA个数分别为2 186、2 091、2 217、2 136、2 176、2 088,新miRNA的个数分别为613、567、668、640、662、450.筛选到701个差异表达novel miRNAs,38个差异表达已知miRNAs.对差异表达miRNAs的靶基因进行GO和KEGG分析,发现主要富集在血管内皮生长因子通路和卵巢类固醇生成等过程.对3个差异miRNAs进行qRT-PCR验证,与测序结果一致.oar-let-7b、oar-miR-29a、oar-miR-134-3p、oar-miR-541-3p等的靶基因富集在TGF-beta通路、卵巢卵泡生长等与卵巢发育相关的生物过程.oar-miR-148a、oar-miR-136的靶基因调控颗粒细胞增殖和类固醇生成,可能参与调控绵羊卵巢发育.

分类号： S826

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