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菠菜雌雄同株性状的全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

作者： 汪豪英;刘志远;王晓武;武剑;张合龙;夏志兰;徐兆生;钱伟

作者机构：

关键词： 菠菜;全基因组;关联分析;雌雄同株

期刊名称：园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2019 年 8 期

页码： 1495-1502

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2020-2021年度） ; 农林核心（2020版） ; 科技核心（2020版）

摘要： 菠菜为典型的雌雄异株植物,少数植株表现为雌雄同株.为了挖掘控制菠菜雌雄同株的基因位点,对82份菠菜高代自交系的性型进行调查分析,同时进行测序深度为10*的重测序.重测序共获得了3 420 496个SNP,过滤后得到1 621 970个多态性高的SNP位点.利用高质量的SNP对菠菜雌雄同株的性状进行了全基因组关联分析(GWAS).利用压缩混合线性模型(compress mixed linear model,cMLM)在菠菜4号染色体上检测到1个强关联区域.基于强关联信号SNP位点LD值(31.2kb)的大小,将控制菠菜雌雄同株的基因X~m定位在64.6kb的区间内.该范围内存在3个基因:Spo24600、Spo24601和Spo24602.该研究在关联区域内开发了KASP标记,可以有效用于菠菜雌雄同株的鉴定.

分类号： S636.1

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