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貂源冠状病毒与2019新型冠状病毒的遗传进化关系

文献类型： 中文期刊

作者： 杨艳玲;程世鹏;任林柱

作者机构：

关键词： 水貂冠状病毒;新型冠状病毒(HCoV-19);基因组;遗传进化关系

期刊名称：中国动物检疫

ISSN： 1005-944X

年卷期： 2020 年 NULL 卷 4 期

页码： 21-26

收录情况： 农林核心（2020版）

摘要： 为进一步明确貂源冠状病毒与新型人冠状病毒HCoV-19的遗传进化关系,比较了NCBI上公布的3株水貂冠状病毒、5株雪貂冠状病毒以及人冠状病毒HCoV-19和SARS-Cov的全基因组、ORF1a、ORF1ab和病毒表面蛋白Spike的序列同源性,分析了其遗传进化关系,以及组成病毒的结构蛋白和非结构蛋白的种类、基因位置及氨基酸数量.结果显示:貂源冠状病毒与新型冠状病毒HCoV-19全基因组、ORF1a、ORF1ab、Spike蛋白的相似性分别为68%、46.96%、52.44%、47.36%;貂源冠状病毒与HCoV-19不属于同一分支,且亲缘关系较远;同时,貂源冠状病毒与HCoV-19全基因组在蛋白组成、氨基酸数量、基因位置上均存在显著差异.结果表明,貂源冠状病毒与新型冠状病毒HCoV-19不是同一种冠状病毒,此次在人群中流行的新型冠状病毒HCoV-19由貂源冠状病毒重组而成的可能性很小,因此可初步排除HCoV-19来源于水貂和雪貂的可能性.

分类号： S852.65

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