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大豆GmGRF5基因的组织表达模式与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张晓玫

作者机构：

关键词： 大豆;GmGRF5;组织表达模式;生物信息学分析

期刊名称：分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2020 年 NULL 卷 5 期

页码： 1393-1400

收录情况： 北大核心（2020版） ; 农林核心（2020版） ; 科技核心（2020版）

摘要： Growth Regulating Factor (GRF)家族基因是一类植物特有的转录因子,广泛参与植物多个重要的发育过程.为了研究大豆中的GRF转录因子的功能,本研究从大豆'天隆1号'品种中克隆获得全长为1 038 bp的cDNA序列,由于该序列的编码蛋白与拟南芥GRF5具有高度的相似性,因此将其命名为GmGRF5基因.通过RT-PCR进行组织部位表达分析,发现GmGRF5基因在大豆各个组织部位均有表达,且在花中的表达量最高.通过ExPASy-Protparam分析发现,该蛋白质的分子量为39.463 48 kD,是具有一定亲水性、不稳定的碱性蛋白.该蛋白含有GRF家族蛋白的两个保守功能域(QLQ和WRC).利用SOPMA对该蛋白的二级结构预测,显示其主要由无规则卷曲(72.05%)、α-螺旋(13.83%)、延伸链区(9.8%)和β-转角(4.32%)组成.此外,还利用不同的生物信息学软件对其三级结构、跨膜域、亚细胞定位、互作蛋白进行了分析,并构建系统进化树.结果表明,Gm GRF5基因在进化过程中具有高度的保守性,在大豆中具有潜在的功能多样性.

分类号： S565.1

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