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马传染性贫血病毒驴白细胞弱毒疫苗株及其亲本强毒株前病毒核苷酸序列比较分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王柳;童光志;刘红全;杨志彪;仇华吉;孙宪刚;王玫

作者机构：

关键词： 马传染性贫血病毒;驴白细胞弱毒疫苗株;马强毒L株;核苷酸序列

期刊名称：中国科学(C辑:生命科学)

ISSN： 1006-9259

年卷期： 2001 年 31 卷 06 期

页码： 35-44

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以马传染性贫血病毒驴白细胞弱毒疫苗株（DLA-EIAV）感染细胞总DNA及其亲本强毒L株感染马外周血液白细胞中DNA为模板,应用PCR方法分段扩增出DLA-EIAV和L株前病毒,并将各段扩增产物克隆后进行测序.根据国外发表的马传染性贫血病毒核苷酸序列,推导出DLA-EIAV和L株全基因组核普酸序列,经比较分析,DLA-EIAV株前病毒基因组全长8266个碱基,EIAV L株前病毒基因组共有8235个碱基.DLA-EIAV株与其亲本L株和DA株核普酸序列相比,同源率分别为97.0％和97.5％.DLA-EIAV株和L株相比,长末端重复序列（LTR,由U3,R,U5组成）、编码囊膜糖蛋白的基因env及ORF S2变异率很高,U3,R,U5,env及ORF S2核苷酸序列差异率分别达13.2％,7.5％,5.1％,2.7％和3.9％,env基因及ORF S2推导的氨基酸序列差异率分别为4.4％和8.8％.从EIAV高度变异的env各个毒株中鉴定出6个氨基酸序列保守区,并发现中国的EIAV强、弱毒增强子区有转录因子GATA结合一致序列.序列比较发现EIAVL比DLA株多2个N连接糖化位点.DLA-EIAV,L和DA株在ENH的主要差别是,DLA-EIAV株含有转录因子bHLH作用一致序列.另外,DLA-EIAV株TAR茎的起始部位发生了改变,形成一个尿嘧啶小泡.这些变异对EIAV毒力的影响有待进一步研究.

分类号： S858.21

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