数字农科院2.0

利用PCR-DGGE溯源典型农村塘坝饮用水中的污染

文献类型： 中文期刊

作者： 冯广达;邓名荣;郭俊;王东东;朱红惠;张曦;梁浩亮;朱昌雄

作者机构：

关键词： 微生物溯源;大肠杆菌;PCR-DGGE;β-D-葡萄糖苷酶编码基因(uidA);膜外周磷通道蛋白编码基因(phoE)

期刊名称：环境科学学报

ISSN： 0253-2468

年卷期： 2011 年 31 卷 03 期

页码： 468-475

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以华南地区典型农村塘坝饮用水为研究对象,采用基于大肠杆菌的两种特异性基因(β-D-葡萄糖苷酶编码基因uidA和膜外周磷通道蛋白编码基因phoE)的群体差异分析(PCR-DGGE),对饮用水中的污染情况进行了溯源研究.结果表明,采用富集培养的混合菌体DNA作为模板扩增大肠杆菌特异性基因更加实用.uidA和phoE的引物均具有较强的特异性.对Genebank中已有的两种特异性基因序列的分析结果表明,phoE的平均变异程度约为uidA的2倍,基于phoE的PCR-DGGE分析技术能够更好地反映样品之间的联系,适合在微生物溯源中应用.研究还表明,塘坝饮用水及其周围环境污染呈现面源特征,养殖废弃物是水体污染的主要来源.

分类号： TU991.2

  • 相关文献

[1]水体粪便污染的微生物溯源方法研究进展. 冯广达,邓名荣,朱红惠,郭俊,张曦,朱昌雄,梁浩亮. 2010

[2]基于拟杆菌特异性16SrRNA基因的塘坝型饮用水污染溯源研究. 张曦,朱昌雄,冯广达,朱红惠,郭萍. 2011

[3]基于拟杆菌特异性16S rRNA基因的塘坝型饮用水污染溯源研究. 张曦,朱昌雄,冯广达,朱红惠,郭萍. 2011

[4]广东某农村塘坝饮用水污染的微生物溯源. 冯广达,邓名荣,郭俊,朱红惠,羊宋贞,梁浩亮,朱昌雄. 2011

[5]利用拟杆菌分子标记物对粪便污染溯源的研究进展. 张曦,朱昌雄,朱红惠. 2011

[6]Buried straw layer and plastic mulching increase microflora diversity in salinized soil. Li Yu-yi,Pang Huan-cheng,Zhao Yong-gan,Wang Jing,Zhai Zhen,Han Xiu-fang,Yan Shou-wei,Zhang Jian-li. 2016

[7]Molecular-based environmental risk assessment of three varieties of genetically engineered cows. Xu, Jianxiang,Zhao, Jie,Wang, Jianwu,Zhao, Yaofeng,Zhang, Lei,Li, Ning,Chu, Mingxing. 2011

[8]The biogeography of fungal communities in wetland sediments along the Changjiang River and other sites in China. Tian, Jianqing,Xiang, Meichun,Sun, Jingzu,Liu, Xingzhong,Wu, Bing,Bai, Chunming.

[9]Microbial diversity in the sediment of a crab pond in Nanjing, China. Liu, Yuchun,Zhou, Zhigang,He, Suxu,Yao, Bin,Ringo, Einar. 2013

[10]Rumen fermentation and bacterial communities in weaned Chahaer lambs on diets with different protein levels. Yang Chun-tao,Si Bing-wen,Diao Qi-yu,Zeng Shu-qin,Tu Yan,Jin Hai. 2016

[11]Gibel carp Carassius auratus gut microbiota after oral administration of trimethoprim/sulfamethoxazole. Liu, Yuchun,Zhou, Zhigang,Xu, Li,Cao, Yanan,Zhang, Yuting,Yao, Bin,Wu, Ning,Tao, Yu. 2012

[12]Application of 16S rDNA-PCR amplification and DGGE fingerprinting for detection of shift in microbial community diversity in Cu-, Zn-, and Cd-contaminated paddy soils. Li, ZJ,Xu, JM,Tang, CX,Wu, JJ,Muhammad, A,Wang, HZ.

[13]Identification of the adherent microbiota on the gills and skin of poly-cultured gibel carp (Carassius auratus gibelio) and bluntnose black bream (Megalobrama amblycephala Yih). Wang, Wenwen,Zhou, Zhigang,He, Suxu,Liu, Yuchun,Cao, Yanan,Shi, Pengjun,Yao, Bin,Ringo, Einar.

[14]耐除草剂转基因大豆对根际土壤固氮微生物nifH基因多样性的影响. 王丽娟,李刚,赵建宁,红雨,修伟明,王慧,章秋艳,杨殿林. 2013

[15]内蒙古贝加尔针茅草原细菌多样性的PCR-DGGE分析. 张永生,赖欣,张静妮,李刚,赵帅,杨殿林. 2010

[16]内蒙古贝加尔针茅草原细菌多样性的 PCR-DGGE分析. 张永生,赖欣,张静妮,李刚,赵帅,杨殿林. 2010

[17]长期施肥对黄棕壤性水稻土氨氧化细菌多样性的影响. 裴雪霞,周卫,梁国庆,孙静文,王秀斌,李双来. 2011

[18]长期不同施肥对暗棕壤甲烷氧化菌群落特征与功能的影响. 杨芊葆,范分良,王万雄,梁永超,李兆君,崔喜安,魏丹. 2010

[19]应用DGGE法研究甘草内生细菌多样性. 张敏,李俊,沈德龙,姜昕,李力. 2009

[20]蔗渣垫料在零排放发酵床养猪中的应用研究. 肖佳华,刘云浩,郭萍,朱昌雄. 2013

作者其他论文 更多>>