基于叶绿体基因多样性的中国水稻起源进化研究
文献类型: 中文期刊
作者: 王荣升;魏鑫;曹立荣;乔卫华;张万霞;杨庆文
作者机构:
关键词: 水稻;叶绿体;基因多样性;起源;籼粳分化
期刊名称:植物遗传资源学报
ISSN: 1672-1810
年卷期: 2011 年 05 期
页码: 686-693
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 选择原产中国的98份亚洲栽培稻和125份普通野生稻为材料,对叶绿体中atpA序列、rps16内含子序列、trnP-rp l33间隔区、trnG-trnfM序列、trnT-trnL间隔区序列的5段高突变序列进行测序,利用生物信息学方法进行比对分析,绘制Network网络图,构建系统发育树。结果表明,普通野生稻的Indel和SNP数目均比亚洲栽培稻多,序列多样性丰富;基于单倍型的Network网络图和系统发育树可将所有参试材料归为3个类群,类群I主要为粳稻与普通野生稻,类群II主要为籼稻,类群III主要为普通野生稻,而类群II和类群III亲缘关系较近,提示粳、籼两个亚种可能由偏粳、偏籼的普通野生稻分别进化而来,支持二次起源学说;所有与亚洲栽培稻亲缘关系较近的普通野生稻均来源于华南地区,支持华南地区为我国亚洲栽培稻起源中心的论点。
分类号: S511
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