iTRAQ联合LC-MS/MS技术分析痢疾杆菌耐酸性研究
文献类型: 中文期刊
作者: 魏小娟;张继瑜;周绪正;李冰;程富胜;牛建荣;王娟娟
作者机构:
关键词: 痢疾杆菌;LC-MS/MS技术;iTRAQ;菌体蛋白;耐酸性;报告基团;质谱数据;催化活性;差异蛋白;细胞代谢过程
期刊名称:
ISSN:
年卷期: 2015 年
页码: 1
收录情况: CSCD
摘要: 【目的】应用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)联合液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)技术检测痢疾杆菌168株在不同处理条件下(普通培养与酸处理组)蛋白的差异情况,从而筛选出与痢疾杆菌耐酸性相关的潜在菌体蛋白。【方法】以痢疾杆菌301标准株为对照,通过模拟建立耐酸性菌株,采用iTRAQ技术和生物信息学鉴定并相对定量各菌株菌体蛋白。质谱数据经DataAnalysis4.0软件分析,用Mascot2.3.02蛋白质鉴定软件对SwissProt下载的痢疾杆菌数据库进行搜索,软件依据同位素报告基团的相对含量进行蛋白质定量,以报告基团113为参照,选择差异性显著(P<0.05)的结果进行报告。当差...
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