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甜菜NADH-NR基因的克隆和序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 丁广洲;侯静;陈丽;马凤鸣;陈连江

作者机构：

关键词： 甜研7号;NADH-NR基因;克隆;序列分析

期刊名称：生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2011 年 0 卷 10 期

页码： 90-96

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用同源序列克隆方法从标准偏高糖型甜菜品种甜研7号(Ty7)中获得氮素诱导NADH-NR基因片段,通过RACE技术克隆NADH-NR基因全长序列。该基因ORF长度2 718 bp,编码905个氨基酸,包括147 bp的5'UTR和382 bp的3'UTR,GenBank上的注册号为EU163265,基因编码蛋白的等电点为6.12,推测分子量大小为102 kD,C端(778-891 aa)有一个跨膜区域。基因编码多肽含有3个氧化还原功能区:钼辅因子功能区(eukary NR Moco,93-478aa),Fe-血红素结合区(Cyt-b5,535-608 aa),FAD结合区(FAD binding 6,653-760 aa)。在甜研7号NR下游的氨基酸残基中含有NADH-NR特有的CGPPP-M基序,说明该蛋白以NADH为电子供体。通过比对,甜研7号的NADH-NR基因与菠菜NADH-NR基因同源性最高,为86.18%。经Southern杂交检验,甜研7号中NADH-NR基因以低拷贝数存在。经基因组克隆分析,甜研7号NADH-NR含有3个内含子,4个外显子。

分类号： S566.3`Q943.2

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