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苎麻与大麻CesA1基因的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 陈平;喻春明;王延周;陈继康;熊和平

作者机构：

关键词： 纤维素合成酶;苎麻;大麻;生物信息学分析

期刊名称：中国麻业科学

ISSN： 1671-3532

年卷期： 2013 年 003 期

页码： 118-121,154

摘要： 本文利用生物信息学方法从转录组测序数据库中分离了苎麻纤维素合成酶CesA1(BnCesA1)基因全长编码区序列(NCBI登录号:KC112993),并与大麻纤维素合成酶(CsCesA1)进行了氨基酸组成成分、理化性质以及二级结构比较,构建了CesA1基因家族的进化树.结果显示BnCesA1由3249个碱基组成,编码1082个氨基酸组成的蛋白,CsCesA1由3198个碱基组成,编码1065个氨基酸组成的蛋白.它们是疏水性脂溶蛋白,都含有6个跨膜区,二级结构以α-螺旋和无规卷曲为主,存在小部分β-转角或扩展链.两基因的核酸序列同源性为86%,氨基酸序列同源性为93%.本文结果为麻类作物纤维素合成酶基因的进一步功能分析提供了基础.

分类号： S563.1

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