数字农科院2.0

不同类型鸡趾长伸肌中基因表达谱差异分析

文献类型： 中文期刊

作者： 章明;束婧婷;屠云洁;姬改革;单艳菊;盛中伟;张笛;邹剑敏

作者机构：

关键词： 清远麻鸡;科宝肉鸡;肌纤维;差异表达基因;表达谱芯片

期刊名称：扬州大学学报(农业与生命科学版)

ISSN： 1671-4652

年卷期： 2016 年 37 卷 03 期

页码： 47-53

收录情况： 北大核心

摘要： 采用Agilent鸡全基因组表达谱芯片对生长速度较慢的慢速型地方鸡品种清远麻鸡和生长速度较快的快大型肉鸡科宝500肉鸡趾长伸肌中与肌纤维生长发育相关的候选基因及信号通路进行系统筛查,以期探究其差异机制。结果表明:芯片分析共筛选到差异倍数在2倍及以上的基因1 225个,以科宝肉鸡为参照,清远麻鸡中482个基因上调,743个基因下调。选取7个差异表达基因进行qRT-PCR,对芯片结果进行了验证。基于KEGG Pathway分析发现,差异基因除参与肌纤维生长发育和分化相关信号通路(如Ca2+信号通路和Hedgehog信号通路)外,MAPK信号通路、Wnt信号通路、JAK-STAT信号通路、ErbB信号通路、脂肪酸合成信号通路等一些与能量代谢相关的信号通路也被富集为显著的信号通路。根据GO及KEGG Pathway分析结果,发现了23个基因可能与鸡肌纤维生长发育相关,这些基因在肌纤维生长发育过程中的作用尚有待深入研究。

分类号： S831.2

  • 相关文献

[1]基于表达谱芯片挖掘清远麻鸡和科宝肉鸡比目鱼肌差异表达基因. 束婧婷,章明,宋迟,单艳菊,徐文娟,宋卫涛,李慧芳. 2016

[2]基于表达谱芯片筛选鸡不同部位皮肤组织差异表达基因. 姬改革,束婧婷,单艳菊,章明,屠云洁,刘一帆,巨晓军,邹剑敏. 2018

[3]烟粉虱不同发育阶段解毒代谢酶基因的特异性表达. 杨妮娜,张友军,杨鑫,黄大野,龙同,万鹏. 2016

[4]固氮斯氏假单胞菌全基因组测序和表达谱初步分析. 燕永亮,杨剑,窦岳坦,何升,李红权,平淑珍,彭俊平,王忆平,金奇,林敏. 2006

[5]基于表达谱芯片挖掘鸡骨骼肌不同类型肌纤维的差异表达基因. 束婧婷,姬改革,单艳菊,章明,肖芹,屠云洁,盛中伟,张笛,邹剑敏. 2017

[6]利用RNAi和表达谱芯片分析日本血吸虫Sj34.9基因的功能. 刘萍萍,石艳丽,杨云霞,刘金明,林矫矫,金亚美. 2012

[7]清远麻鸡生长激素基因(GH)的SNPs检测及其对生长及繁殖性状的遗传效应. 束婧婷,张莹,尹平安,韩威,宋卫涛,邝智祥,李慧芳. 2011

[8]清远麻鸡CAPN1基因单核苷酸多态性研究. 高海军,束婧婷,李慧芳,张莹,邝智祥,陈宽维. 2010

[9]清远麻鸡H-FABP和A-FABP基因mRNA的差异表达研究. 屠云洁,苏一军,王克华,张学余,李国辉. 2010

[10]清远麻鸡成纤维细胞库构建及生物学研究. 关伟军,马月辉,梁海青,于太永,张海艳. 2005

[11]基于连接酶检测反应的NPY基因多态与清远麻鸡繁殖性状的相关性研究. 张莹,束婧婷,韩威,宋卫涛,陈宽维,李慧芳. 2010

[12]清远麻鸡体重和胫长生长曲线的拟合. 邹剑敏,宋迟,单艳菊,宋卫涛,束婧婷. 2012

[13]基于连接酶检测反应的PRL基因多态与清远麻鸡繁殖性能的相关性研究. 束婧婷,李慧芳,邹剑敏,张莹,陈宽维,尹平安,韩威,宋卫涛. 2011

[14]甜高粱和玉米青贮对肉羊肌纤维组织及其 相关肉质性状的影响. 王婷,侯明杰,尚占环,王虎成. 2018

[15]不同日龄和性别白羽王鸽肉品质、主要营养成分及肌纤维特性的比较研究. 卜柱,常玲玲,汤青萍,宋迟,张蕊,付胜勇,穆春宇. 2018

[16]鸭发育早期骨骼肌TNNI1基因mRNA表达及与肌纤维生长的相关性分析. 姬改革,单艳菊,章明,屠云洁,巨晓军,张笛,束婧婷. 2017

[17]MyoG和c-fos基因多态性及其合并基因型与猪肌纤维性状的关联分析. 郭云雁,程笃学,张龙超,颜华,赵克斌,王立贤,刘文忠,郭慧慧,陈来华. 2013

[18]鸭骨骼肌早期发育过程中钙蛋白酶3(CAPN3)基因的表达及其与肌纤维性状的关联. 朱文奇,徐文娟,束婧婷,陈文峰,单艳菊,刘宏祥,胡艳,李慧芳,王金玉. 2014

[19]CaNAα基因在清远麻鸡和隐性白羽鸡不同表型肌肉中的表达. 徐文娟,单艳菊,章明,束婧婷,宋迟,李慧芳. 2015

[20]CaN/NFAT信号通路相关基因在鸡骨骼肌中的表达规律及关联分析. 盛中伟,单艳菊,束婧婷,章明,姬改革,屠云洁,范建华,邹剑敏. 2017

作者其他论文 更多>>