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大蒜全基因组NCED基因鉴定与功能初探

文献类型： 中文期刊

作者： 袁晓戈;李富;张雪钰;曾铮;何巧芸;周智满;王延周;杨喜爱;刘头明

作者机构：

关键词： 大蒜;NCED基因;差异表达;基因功能

期刊名称：中国蔬菜

ISSN： 1000-6346

年卷期： 2023 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; 科技核心（2023版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 采用生物信息学方法，从大蒜基因组中共鉴定出AsaNCED基因14个，预测其氨基酸数量为409～599个，蛋白分子量为46 421.95～67 090.27 Da，理论等电点为5.48～6.87。多数基因外显子数为1个，少数为11～12个。在启动子顺式作用元件中，光、脱落酸和茉莉酸甲酯响应元件在数量上占据优势，并广泛分布在不同的基因家族成员中；同时也存在与干旱相关的MYB结合位点、防御与胁迫响应元件、伤口响应元件和种子特异性调控元件。该基因家族成员在不同组织中具有一定的表达差异性。通过异源过表达AsaNCED4获得转基因拟南芥，其株高明显低于野生型，qRT-PCR分析发现AsaNCED4基因受盐胁迫诱导上调表达。

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