不同颜色辣椒果实中花青素生物合成相关的内参基因筛选及验证
文献类型: 中文期刊
作者: 王晨媛;何巧芸;王婷丽;唐佳灵;郭媛;邓炎春;侯春生
作者机构:
关键词: 辣椒;实时荧光定量PCR;内参基因;花青素合成
期刊名称:中国蔬菜
ISSN: 1000-6346
年卷期: 2025 年
页码:
收录情况: 北大核心(2023版) ; ; 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2024版)
摘要: 为筛选出适用于辣椒不同品种和不同果实组织中花青素合成基因相对表达量分析的内参基因,本研究选取GAPDH、Actin、β-TUB、PP2A、UBQ2、DNA-J、ATPS和ACBP 8个常见候选内参基因,利用实时荧光定量PCR(q RTPCR)技术对6个辣椒品种、3种不同颜色(黄色、红色和绿色)果实(胎座、果肉和种子)中候选内参基因的表达情况进行检测,利用Ge Norm、Norm Finder、Best Keeper和Ref Finder软件评估候选内参基因的表达稳定性。结果表明,在辣椒不同品种的果实中,3-磷酸甘油醛脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)基因GAPDH是最适内参基因,而ATP合成酶基因(ATP synthase)基因ATPS是最不适宜内参基因。以GAPDH作为内参基因,利用q RT-PCR对辣椒不同品种的果实不同组织(胎座、果肉和种子)进行花青素合成途径关键基因,即查尔酮合成酶(chalcone synthase)基因CHS和查耳酮异构酶(chalcone isomerase)基因CHI的表达分析,结果显示CHS和CHI在3个品种辣椒果实(分别为黄色、红色和绿色)中表达水平均有显著性差异,其表达趋势与转录组数据基本一致;当以ATPS作为内参基因时,CHS和CHI表达趋势与转录组数据不一致。结果显示GAPDH是辣椒不同品种果实不同组织中稳定表达的内参基因。研究为辣椒不同品种和果实不同组织中花青素合成相关基因的功能分析及其调控机理研究提供了参考。
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