青枯菌侵染下不同类型烟草根系转录组比较分析
文献类型: 中文期刊
作者: 章慧芬;张玉芹;曹长代;孙刚;温亮;刘洋;刘正文;肖志亮;耿锐梅;任民;李丽华;杨爱国
作者机构:
关键词: 烟草;青枯病;转录组;优势表达基因;抗性机制
期刊名称:中国烟草科学
ISSN: 1007-5119
年卷期: 2024 年
页码:
收录情况: 北大核心(2023版) ; ; CSCD(2023-2024年度) ; ; 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2020版)
摘要: 采用转录组测序(RNA-seq)方法,探究了雪茄烟品种Beinhart 1000-1与烤烟品种小黄金1025在青枯菌侵染下的转录响应差异。结果显示,在侵染I阶段,Beinhart 1000-1中鉴定到568个优势表达基因,主要富集在碳水化合物代谢与淀粉和蔗糖代谢等通路,小黄金1025中鉴定到1 028个优势表达基因,主要富集在信号转导与转录因子等通路;结合全基因组家族成员鉴定,在Beinhart 1000-1优势表达基因中鉴定到15个细胞壁合成与重塑相关基因以及3个信号转导相关的APETALA2/ethylene responsive factor(AP2/ERF)家族成员,而小黄金1025优势表达基因中分别鉴定到3和24个上述相关成员;此外,侵染I阶段Beinhart 1000-1根系中的青枯菌生物量明显少于小黄金1025。可见,Beinhart 1000-1与小黄金1025在青枯菌侵染早期阶段转录响应存在较大差异。
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