猪繁殖与呼吸综合征病毒NSP2基因新缺失模式(1+1+111+1+19)的序列特征分析
文献类型: 中文期刊
作者: 焦守德;张婧;马雪青;李平花;王健;卢曾军;王富强;孙普
作者机构:
关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒;L1C-like猪繁殖与呼吸综合征病毒;NSP2基因;缺失模式;遗传变异
期刊名称:中国动物传染病学报
ISSN: 1674-6422
年卷期: 2024 年
页码:
收录情况: 北大核心(2023版) ; ; 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2020版)
摘要: 基因高度突变和重组致使猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)新型毒株不断增加,应对其持续监测。掌握最新流行PRRSV毒株的遗传演变特点,可为我国PRRS的防控提供分子流行病学数据参考。本研究利用RT-PCR方法和测序技术,获取甘肃地区猪群中最新流行的一株PRRSV全基因组序列,通过MEGA、RDP4和Simplot软件对其进行基因序列分析,基于其ORF5基因、NSP2基因和全长基因构建系统发育树并进行基因全长重组分析,对比ORF5和NSP2基因编码氨基酸的变异特点。成功测定PRRSVGSQY12-2023株全基因组序列,长15 032个核苷酸,基于ORF5基因的系统发育分析揭示其属于NADC30-like(L1C-like)毒株的L1C-D分支,其NSP2蛋白出现了新型缺失模式(1+1+111+1+19),重组分析发现该毒株可能由NADC30株和JXA1株分别为潜在主要和潜在次要亲本重组演化而来。本研究首次发现甘肃地区猪群中流行L1C-D-like PRRSV,并报道了其NSP2基因的新型缺失模式,这为PRRSVs的基因多样性和遗传演化研究提供了新的见解。
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