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基于宏基因组学分析SPF动物房内细菌多样性及消毒剂作用效果评价

文献类型： 中文期刊

作者： 岳涛;冯小明;李爽;于远光

作者机构：

关键词： 屏障系统;粪便;宏基因组;消毒;菌群丰度

期刊名称：甘肃农业大学学报

ISSN： 1003-4315

年卷期： 2025 年

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2025-2026年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2024版）

摘要： 【目的】系统分析SPF动物房环境微生物与小鼠粪便的细菌多样性、丰度差异，评估常用消毒剂的消毒效果，为构建科学规范的SPF实验动物生产屏障系统提供依据。【方法】采集环境及粪便样本，通过16S rRNA V3-V4区扩增测序（Illumina MiSeq平台）进行微生物群落分析，结合Alpha/Beta多样性评估。采用不同消毒剂处理环境样本，通过菌落计数评价消毒效果。【结果】对有效数据进行OTU序列分析，稀释性曲线证明数据量合理，SPF动物房环境与粪便中以厚壁菌门与拟杆菌门为主；属水平上分析显示，环境与粪便中微生物主以肠球菌属、乳杆菌属、埃希氏菌属和志贺菌属为主。样本间差异分析显示，来自环境样本或粪便样本的菌群组成相似性较高；Beta分析显示，来自环境的样本与来自粪便的样本群落结构相似，但丰度差异较大。【结论】SPF动物房环境微生物主要以厚壁菌门细菌为主，小鼠粪便微生物主要以厚壁菌门与拟杆菌门为主。SPF小鼠粪便微生物多样性高于SPF动物房环境微生物多样性。3种不同消毒剂对不同消毒目标的消毒效果不同。

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