数字农科院2.0

Rab5、Rab7、Rab9、LAMP1蛋白SYBR Green I 荧光定量PCR检测方法的建立

文献类型: 中文期刊

作者: 鲍云;李爽;杨敏;刘义杰;邵圆梦;高飞;李丽薇;童武;李国新;刘长龙;周艳君;姜一峰

作者机构:

关键词: Rab蛋白;早期内体;晚期内体;荧光定量PCR;SYBR Green I

期刊名称:中国动物传染病学报

ISSN: 1674-6422

年卷期: 2025 年

页码:

收录情况: 北大核心(2023版) ; ; 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2024版)

摘要: Rab蛋白是GTPases的Ras超家族成员之一,是胞内蛋白在各细胞器之间的运输中具有GTP酶活性的分子开关,同时也是细胞内吞和分泌系统中各种细胞器和囊泡的标志性蛋白。本研究建立了快速高效检测Rab5、Rab7、Rab9、LAMP1基因的方法,根据GenBank中Rab5、Rab7、Rab9、LAMP1基因序列设计引物,提取猪肺泡巨噬细胞的总RNA反转录成cDNA,以其为模板分别对4种基因进行扩增,再连接到pcDNA3.1载体上获得重组质粒,以此作为标准品质粒,从而建立SYBR Green I荧光定量PCR检测方法。实验结果显示:该方法在102~108 copies/μL范围内呈现出良好的线性关系;与常规PCR相比,敏感性提高了10~1000倍;利用该方法检测4种基因,互相无交叉反应;组内和组间变异系数均小于3%,结果表明,Rab5、Rab7、Rab9、LAMP1的SYBR Green I荧光定量PCR检测方法具有良好的敏感性、特异性和重复性,可用于Rab5、Rab7、Rab9、LAMP1基因的定量检测,为进一步研究猪病病原微生物在感染过程中的膜泡运输和抗原加工机制提供了准确有效的工具。

分类号:

  • 相关文献

[1]猪脑心肌炎病毒SYBR Green Ⅰ real-time PCR检测方法的建立. 施开创,陈进喜,屈素洁,许瑞胜,熊毅,刘棋,陈汉忠,李刚. 2009

[2]猪源转录因子SP1 SYBR Green I 荧光定量PCR检测方法的建立. 沈奇,虞凌雪,高飞,刘长龙,周艳君,李国新,童光志,李丽薇,姜一峰. 2022

[3]猪流行性腹泻病毒SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法的建立. 董苏洁,孔宁,秦文珍,翟焕杰,翟雪滢,杨心雨,童武,郑浩,于海,童光志,李有文,单同领. 2022

[4]新城疫病毒Mukteswar株感染鸡巨噬细胞入胞及胞内转运途径研究. 黄新月,谭磊,宋翠萍,仇旭升,孙英杰,刘炜玮,廖瑛,丁铲,吴艳涛. 2022

[5]Rapid detection and quantification of zearalenone-producing Fusarium species by targeting the zearalenone synthase gene PKS4. Meng, Kun,Wang, Yaru,Yang, Peilong,Luo, Huiying,Bai, Yingguo,Shi, Pengjun,Yuan, Tiezheng,Ma, Rui,Yao, Bin. 2010

[6]A duplex, SYBR Green I-based RT-qPCR assay for the simultaneous detection of Apple chlorotic leaf spot virus and Cherry green ring mottle virus in peach. Liang, Pengbo,Wang, Hongqing,Zhao, Zhe,Yu, Yun,Zhang, Zhixiang,Liang, Pengbo,Ma, Yuxin,Li, Shifang. 2013

[7]A SYBR Green I-based real-time polymerase chain reaction assay for detection and quantification of canine bufavirus. Yong Wang,Jianfei Sun,Xu Guo,Wei Li,Da Zhang,Guangqing Liu,Tianhong Zhou,Yongdong Li. 2021

[8]A Novel Fluorescent Sensor Based on Aptamer and qPCR for Determination of Glyphosate in Tap Water. Shao Y.,Tian R.,Duan J.,Wang M.,Cao J.,Cao Z.,Li G.,Jin F.,Abd El-Aty A.M.,She Y.. 2023

[9]1-2月龄荷斯坦奶牛不同组织中FMDV受体亚基αv、β3、β6 mRNA转录水平的相对定量研究. 独军政,常惠芸,薛霜,高闪电,丛国正,邵军军,林彤,包慧芳,才学鹏. 2010

[10]1—2月龄荷斯坦奶牛不同组织中FMDV受体亚基αv、β3、β6 mRNA转录水平的相对定量研究. 独军政,常惠芸,薛霜,高闪电,丛国正,邵军军,林彤,包慧芳,才学鹏. 2010

[11]猪背最长肌PFK-2/FBPase-2荧光定量RT-PCR方法的建立. 李朋颖,汤晓艳,王敏,康大成,颜成英. 2014

[12]烟草赤星病菌实时荧光定量PCR检测方法的建立. 谢中玉,王晓强,沈宏,孙光军,李斌,崔志燕,张永峰,冉茂,陈海涛,张帅,汪代斌,陈德鑫,孙现超. 2021

[13]靶向伪狂犬病病毒UL35基因的SYBR Green I荧光定量PCR方法的建立. 张心雨,吴红霞,李永锋,孙元,付强,仇华吉. 2024

[14]棉铃虫离子型受体基因HarmIR8a的克隆及表达定位. 张夏瑄,郭孟博,刘一鹏,王冰,王桂荣. 2018

[15]利用荧光定量PCR技术鉴别畜禽肉中猪源性成分. 陆俊贤,唐修君,樊艳凤,贾晓旭,葛庆联,顾荣,王珏,高玉时. 2017

[16]花生果糖-1;6-二磷酸醛缩酶基因AhFBA1的克隆与表达. 陈娜,潘丽娟,迟晓元,陈明娜,王通,王冕,杨珍,胡冬青,王道远,禹山林. 2014

[17]荧光定量PCR检测硬蜱体内莱姆病螺旋体的研究. 曹杰,仝彩玲,周勇志,张厚双,周金林. 2010

[18]茶尺蠖核型多角体病毒荧光定量PCR检测方法的建立. 杜军利,张传溪,肖强,付建玉,殷坤山. 2010

[19]基于qPCR技术快速检测青枯劳尔氏菌5号生理小种的方法. 曹梦琪,包奇,杨采风,王俊,盛晟. 2015

[20]北京、山东和湖南地区烟粉虱抗药性及CYP4v2和CYP6CX1mRNA水平表达量分析. 杨鑫1,谢文2,王少丽2,吴青君2,徐宝云2,周小毛1,张友军2. 2014

作者其他论文 更多>>