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用于水稻品种真实性验证的SNP位点评价

文献类型： 中文期刊

作者： 徐群;王珊;袁筱萍;金石桥;晋芳;郝万军;吴小碧;冯跃;余汉勇;孙燕飞;杨窑龙;魏兴华

作者机构：

关键词： 水稻品种;真实性鉴定;RGIsnp96;高鉴别力

期刊名称：中国水稻科学

ISSN： 1001-7216

年卷期： 2025 年

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2025-2026年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2024版）

摘要： 【目的】高鉴别力的SNP位点组合对建立高效、精准、低成本的水稻品种验证技术至关重要，可广泛应用于种子监管和品种创新等领域。【方法】本研究利用农业行业标准推荐的96个SNP标记（RGIsnp96），构建1383个常规种和2702个杂交种水稻品种的SNP指纹图谱。【结果】发现在常规种中，杂合基因型比率、平均多态性信息成分（PIC）、平均次要等位基因频率（MAF）分别为0.03、0.30和0.27；在杂交种中，相关指标分别为0.39、0.30和0.29。RGIsnp96对常规稻、杂交稻的品种识别率分别为99.94%、99.99%。基于品种间异同基因型位点的比例，对RGIsnp96与农业行业标准推荐的48个SSR标记（RGIssr48）的鉴定结果进行比较，结果显示，不论是对于常规种、还是杂交种，这两套标记均具有良好的等效性。同时，还发现对部分常规品种的鉴别，组合不同类型的标记，比单一类型的标记能取得更好的效果，并推荐了相应的策略。【结论】RGIsnp96展现出卓越的水稻品种鉴别能力，为提升水稻种子质量、规范种子市场秩序以及保障农民权益提供了坚实的技术支持。

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