浙江省水稻种质资源的遗传相似度分析
文献类型: 中文期刊
作者: 严志琴;章孟臣;陈小央;李燕;徐群;王珊;冯跃;魏兴华;杨窑龙
作者机构:
关键词: 稻种资源;核心SNP标记;遗传相似度;表型变异
期刊名称:植物遗传资源学报
ISSN: 1672-1810
年卷期: 2025 年
页码:
收录情况: 北大核心(2023版) ; ; CSCD(2025-2026年度) ; ; 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2024版)
摘要: 浙江省水稻栽培历史悠久,拥有丰富的稻种资源。目前保存在国家水稻种质资源中期库(杭州)的浙江省稻种资源共有2000余份,但并没有进行系统的筛选鉴定,导致会存在一些重复保存的稻种资源。本研究以1970份浙江省原产稻种资源为研究材料,利用第二代重测序技术构建了浙江省稻种资源的基因组变异图谱,通过对测序深度、连锁不平衡、缺失率等条件进行SNP过滤,筛选10,532个核心SNP标记用于遗传相似度计算。本研究对13组主要的同名品种进行分析,同名品种之间的遗传相似度均未超过95%,且相互之间存在较大的表型变异,因此同名材料间实际为不同的水稻品种。同时利用1970份材料的核心SNP标记,通过计算两两遗传相似度,筛选出13个高遗传相似度的材料组合。比较表型鉴定结果、植株形态特征发现,高遗传相似度的材料具有高度相似的表型与田间表现,在一定程度上证实了遗传相似度在水稻品种鉴定中的有效性。本研究基本摸清了浙江省水稻种质资源家底,为浙江水稻种质资源的保护和利用提供了重要的科学依据。
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