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谷子热激蛋白HSP90家族基因鉴定及分析

文献类型： 中文期刊

作者： 桑璐曼;汤沙;张仁梁;贾小平;刁现民

作者机构：

关键词： 谷子; HSP90; 基因家族; 基因表达; 单倍型分析

期刊名称：植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2022 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2021-2022年度） ; 科技核心（2021版） ; 农林核心（2020版）

摘要： 热激蛋白90（heat shock protein 90，HSP90）广泛参与生物体的生长发育，对研究信号转导、细胞周期调控、蛋白降解及转运等生理生化代谢具有重要研究价值。为全面解析谷子HSP90基因家族信息，找到重要耐旱SiHSP90的优异单倍型，基于谷子基因组数据，利用生物信息学的方法对谷子HSP90基因家族成员进行了鉴定分析。结果表明，从谷子基因组水平共鉴定到9个SiHSP90家族基因，分布于5条染色体上，内含子数1～19不等，编码蛋白质氨基酸个数为404～818；系统进化树分析结果显示，谷子HSP90家族基因分为4组；亚细胞定位预测结果显示该家族基因主要位于细胞质和内质网；基于已发表的谷子转录组数据进行组织表达分析，不同HSP90基因在不同组织中的表达模式不同；顺式作用元件分析得到9个响应胁迫与激素调控元件，表明谷子HSP90家族基因可在不同非生物胁迫下进行转录调控，响应不同的环境胁迫。耐旱与旱敏感的表达谱分析表明，HSP90家族基因Seita.7G009200在两类材料的多个组织表现极显著差异表达，对532份谷子品种Seita.7G009200基因进行单倍型分析发现，基因区变异极少，启动子区变异丰富，共分为4个单倍型，结合表型分析发现H004是最优异耐旱单倍型，且核心变异位点位于结合茉莉酸甲酯的顺式作用元件核心序列。

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